RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490081.5

HDAC1-210, Transcript of histone deacetylase 1, humanhuman

TSL 3

Gene HDAC1, Length 1,047 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1-210ENST00000490081 REC114Q7Z4M0 266 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 C1QL4Q86Z23 238 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 NPIPB3Q92617 1050 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 SLC35E1Q96K37 410 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 TRGV9Q99603 122 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 MBD2Q9UBB5 411 aa9.56□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 A8MWP6 167 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 PPP5D1E7EU14 171 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 G3V3Q6 166 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 K7EMT4 169 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 OR2C1O95371 312 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-23P01764 117 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 OR10J1P30954 320 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 Q5BKY6 102 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 OR8G2PQ6IF36 304 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 ST6GAL2Q96JF0 529 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 AQP10Q96PS8 301 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 S4R3C0 116 aa9.55□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 HMSDA8MTL9 139 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 CCNKO75909 580 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 CST7O76096 145 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 CFDP00746 253 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 IGHV3-48P01763 117 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 FABP1P07148 127 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 NHLH2Q02577 135 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 SLC38A11Q08AI6 406 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 TCTE3Q8IZS6 198 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 UBAC2Q8NBM4 344 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 HSPB11Q9Y547 144 aa9.54□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 OVOL1O14753 267 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 MPDU1O75352 247 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 TOMM40O96008 361 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 C8orf88P0DMB2 117 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 INSL3P51460 131 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 SLURP1P55000 103 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 SELENOTP62341 195 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 TEPPQ6URK8 271 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 TREML4Q6UXN2 200 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF546Q86UE3 836 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 OR9G4Q8NGQ1 327 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 Q8WTZ3 238 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM190Q8WZ59 177 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 MARC2Q969Z3 335 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 ACY3Q96HD9 319 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 DUX3Q96PT4 197 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 UQCC1Q9NVA1 299 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 PEMTQ9UBM1 199 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.53□□□□□ -0.88
HDAC1-210ENST00000490081 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 IL34Q6ZMJ4 242 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 OR5C1Q8NGR4 320 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ELOVL1Q9BW60 279 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 GPR61Q9BZJ8 451 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 WDR83OSQ9Y284 106 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 UFC1Q9Y3C8 167 aa9.52□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ZFP92A6NM28 416 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 DFFBO76075 338 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 RD3LP0DJH9 198 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 CD33P20138 364 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 SYNJ2BPP57105 145 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 RAB31Q13636 194 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 TIGITQ495A1 244 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 LILRB2Q8N423 598 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 TMEM217Q8N7C4 229 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 OR51G1Q8NGK1 321 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 A0A1B0GVG6 124 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 PSG1P11464 419 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 PLP1P60201 277 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 AKR1C1Q04828 323 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 OR2F1Q13607 317 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 ZNF345Q14585 488 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 PXDC1Q5TGL8 231 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 AKAP14Q86UN6 197 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 NEURL2Q9BR09 285 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 GINS3Q9BRX5 216 aa9.5□□□□□ -0.89
HDAC1-210ENST00000490081 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.5□□□□□ -0.89
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