RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489601.1

SH3BP4-210, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 638 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-210ENST00000489601 HLA-DMBP28068 263 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 CTF1Q16619 201 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 C2orf83Q53S99 150 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 ACTL10Q5JWF8 245 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 STEAP1BQ6NZ63 245 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 PRSS54Q6PEW0 395 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 C16orf54Q6UWD8 224 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 Q8WTZ3 238 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 GLYATL2Q8WU03 294 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 X6R8D5 127 aa12.01□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 GABARAPH6UMI1 98 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 GABARAPO95166 117 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 OR5AC1P0C628 307 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 SLC25A4P12235 298 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 DHRS2Q13268 280 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 LHFPL5Q8TAF8 219 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 GLMPQ8WWB7 406 aa12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 RAB40CQ96S21 281 aa12□□□□□ -0.49
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SH3BP4-210ENST00000489601 OR10J1P30954 320 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 RND2P52198 227 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 DHODHQ02127 395 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR146Q96CH1 333 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 NAA60Q9H7X0 242 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 TBC1D24Q9ULP9 559 aa11.99□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
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SH3BP4-210ENST00000489601 MEF2DQ14814 521 aa11.98□□□□□ -0.49
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SH3BP4-210ENST00000489601 SLC24A4Q8NFF2 622 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 CACNG5Q9UF02 275 aa11.98□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR107Q5VW38 600 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 NOXA1Q86UR1 476 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 RNF126Q9BV68 326 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 MIXL1Q9H2W2 232 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 CACFD1Q9UGQ2 172 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 GPR132Q9UNW8 380 aa11.97□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 CEBPZOSA8MTT3 80 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 DISC1C4P0D8 188 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 BUB3O43684 328 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 IL4P05112 153 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM268Q5VZI3 342 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 FAAP20Q6NZ36 180 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 NPIPB3Q92617 1050 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa11.96□□□□□ -0.49
SH3BP4-210ENST00000489601 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 NXPH3O95157 252 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 TOMM40O96008 361 aa11.95□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 NPY1RP25929 384 aa11.95□□□□□ -0.5
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SH3BP4-210ENST00000489601 CELA1Q9UNI1 258 aa11.95□□□□□ -0.5
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SH3BP4-210ENST00000489601 CTDSPLO15194 276 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 AKAIN1P0CW23 69 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 RD3LP0DJH9 198 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 SMIM18P0DKX4 95 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 C12orf74Q32Q52 190 aa11.94□□□□□ -0.5
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SH3BP4-210ENST00000489601 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 IL22RA2Q969J5 263 aa11.94□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 CTDSP2O14595 271 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 RGS5O15539 181 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 PSG1P11464 419 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 ACY3Q96HD9 319 aa11.93□□□□□ -0.5
SH3BP4-210ENST00000489601 XCL2Q9UBD3 114 aa11.93□□□□□ -0.5
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