RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 DEFB4AO15263 64 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ST8SIA3O43173 380 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 BCL2L11O43521 198 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PITX3O75364 302 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SNAPC5O75971 98 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 S1PR2O95136 353 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 OR2C1O95371 312 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 IGLV2-23P01705 113 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 P0C879 139 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PET100P0DJ07 73 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 C4BPBP20851 252 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 LGALS7P47929 136 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 AKR1C2P52895 323 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RHOGP84095 191 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 OR2F1Q13607 317 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ODF3L2Q3SX64 289 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 BTNL8Q6UX41 500 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 GPHB5Q86YW7 130 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF383Q8NA42 475 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF680Q8NEM1 530 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 AQP10Q96PS8 301 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SPIN2AQ99865 258 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 MAGT1Q9H0U3 335 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 HRH4Q9H3N8 390 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 COA4Q9NYJ1 87 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 CACNG5Q9UF02 275 aa5.25□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 AGRNO00468 2067 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 A0A1B0GU03 582 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 FAM223BA6NKX1 122 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 A8MWP6 167 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 E5RGE8 158 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 H7C2Y5 167 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RAB29O14966 203 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SSSCA1O60232 199 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 FCGR3BO75015 233 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM50AO95807 157 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 KRASP01116 189 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PRH1P02810 166 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 C8orf88P0DMB2 117 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 P0DMU3 169 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 FAM231AP0DMU4 169 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 FAM231CP0DMU5 169 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SLC25A6P12236 298 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 G6PCP35575 357 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ID3Q02535 119 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ATP5G2Q06055 141 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SMCO1Q147U7 214 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF767PQ75MW2 155 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 FAM223AQ8IWN6 122 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 OR2C3Q8N628 320 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 OR11H2Q8NH07 326 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC140Q96MF4 163 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ARPC5LQ9BPX5 153 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 CYTL1Q9NRR1 136 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 NSG2Q9Y328 171 aa5.24□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 FAM24AA6NFZ4 105 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ATP6V1G1O75348 118 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 HPRT1P00492 218 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 AMBPP02760 352 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RLN2P04090 185 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 OR9G9P0C7N8 305 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 APELAP0DMC3 54 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 RPL12P30050 165 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 HTR2BP41595 481 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 P2RY1P47900 373 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PAX9P55771 341 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 TNP2Q05952 138 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 Q6ZTC4 211 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SLC51BQ86UW2 128 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ST8SIA2Q92186 375 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.23□□□□□ -1.57
CASQ1-203ENST00000481081 CSTL1Q9H114 145 aa5.23□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms