RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 CLEC3BP05452 202 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 GIPP09681 153 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 GPR183P32249 361 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL3P36405 182 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 CAV2P51636 162 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 SLURP1P55000 103 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 MFAP4P55083 255 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 CD69Q07108 199 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 ARL16Q0P5N6 197 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 DPF1Q92782 380 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4F4Q96R69 305 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD28-208ENST00000463533 MBD2Q9UBB5 411 aa6.47□□□□□ -1.37
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ANKRD28-208ENST00000463533 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa6.46□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 SMLR1H3BR10 107 aa6.46□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 CST7O76096 145 aa6.46□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 RND2P52198 227 aa6.46□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF616Q08AN1 781 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.46□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM252Q8N6L7 170 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 THAP6Q8TBB0 222 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 ACY3Q96HD9 319 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 CTSGP08311 255 aa6.45□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A4P12235 298 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 P2RY1P47900 373 aa6.45□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 TIGITQ495A1 244 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM217Q8N7C4 229 aa6.45□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 ASB13Q8WXK3 278 aa6.45□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 SLC35E1Q96K37 410 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 TXN2Q99757 166 aa6.45□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 G3V3Q6 166 aa6.44□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 FGL1Q08830 312 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 FHL3Q13643 280 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM209BQ5JX69 171 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.44□□□□□ -1.38
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ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A31Q9H0C2 315 aa6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLC1P0CG04 106 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 OR10J1P30954 320 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 AKR1C1Q04828 323 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 STX12Q86Y82 276 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 LILRB2Q8N423 598 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 SYT8Q8NBV8 401 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 ST6GAL2Q96JF0 529 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 ATP6V0BQ99437 205 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.43□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa6.42□□□□□ -1.38
ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.42□□□□□ -1.38
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