RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SFT2D2O95562 160 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGLC1P0CG04 106 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPPCP23582 126 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 INPP1P49441 399 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRIQKQ629K1 86 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APRG1Q8IVJ8 170 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 METTL26Q96S19 204 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 U3KQ87 197 aa11.54□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PITX3O75364 302 aa11.53□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CD5P06127 495 aa11.53□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRYBB3P26998 211 aa11.53□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR10J1P30954 320 aa11.53□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APOC4P55056 127 aa11.53□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PAFAH1B2P68402 229 aa11.53□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.53□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ACY3Q96HD9 319 aa11.53□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OVOL2Q9BRP0 275 aa11.53□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMEM231Q9H6L2 316 aa11.53□□□□□ -0.56
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa11.52□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1W2PS18 150 aa11.52□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NAP1L6A6NFF2 107 aa11.52□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPL11P62913 178 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF124Q15973 351 aa11.52□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WFDC3Q8IUB2 231 aa11.52□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPIPB3Q92617 1050 aa11.52□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MS4A6AQ9H2W1 248 aa11.52□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAP6D1Q9H9H5 199 aa11.52□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NDUFB6O95139 128 aa11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFNA4P05014 189 aa11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC25A6P12236 298 aa11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 P2RY1P47900 373 aa11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q8WTZ3 238 aa11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NDUFA13Q9P0J0 144 aa11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TMED3Q9Y3Q3 217 aa11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BIRC6Q9NR09 4857 aa11.51□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HOXB5P09067 269 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IAPPP10997 89 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL7P13232 177 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEFB135Q30KP9 77 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIR2DL5AQ8N109 375 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM24BQ8N5W8 94 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NARS2Q96I59 477 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRAV2A0A0B4J234 112 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C9orf170A2RU37 121 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM90A26D6RGX4 464 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBE2CO00762 179 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IL4P05112 153 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BTCP35070 178 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q6ZWC4 215 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STPG3Q8N7X2 389 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 STXBP6Q8NFX7 210 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LYSTQ99698 3801 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RABAC1Q9UI14 185 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 U3KQE9 123 aa11.49□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPRY2O43597 315 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MED6O75586 246 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TOMM40O96008 361 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RD3LP0DJH9 198 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DEFB131AP59861 70 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GRAMD2BQ96HH9 432 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC35E1Q96K37 410 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.48□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TENM2Q9NT68 2774 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CENPXA8MT69 81 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ADAP1O75689 374 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSG1P11464 419 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB11AP62491 216 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DHRS2Q13268 280 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GAMTQ14353 236 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LEMD1Q68G75 181 aa11.47□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP11.47□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa11.46□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZFP92A6NM28 416 aa11.46□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 K7EQG2 157 aa11.46□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 WRBO00258 174 aa11.46□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SYNGR2O43760 224 aa11.46□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR4E1P0C645 316 aa11.46□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.46□□□□□ -0.57
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LYG2Q86SG7 212 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms