RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 ZBTB34Q8NCN2 500 aa14.52□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 RAB29O14966 203 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF253O75346 499 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CBLN1P23435 193 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 COX7A1P24310 79 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 FOXL1Q12952 345 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM140Q9NV12 185 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 GPX1P07203 203 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ABHD12Q8N2K0 398 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 OR5B3Q8NH48 314 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 NRN1Q9NPD7 142 aa14.51□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CORTO00230 105 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 PNKDQ8N490 385 aa14.5□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 AMTP48728 403 aa14.5□□□□□ -0.09
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PDE4D-204ENST00000358923 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 GAGE12BA1L429 117 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ATOH7Q8N100 152 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 APELAP0DMC3 54 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF841Q6ZN19 808 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 GATAD1Q8WUU5 269 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 RAB40CQ96S21 281 aa14.49□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CSPG4Q6UVK1 2322 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 PMCHP20382 165 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 OR4A16Q8NH70 328 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 UHRF2Q96PU4 802 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 TENM4Q6N022 2769 aa14.48□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 C22orf46C9J442 243 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 CD24P25063 80 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 RRHO14718 337 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 SAP30O75446 220 aa14.47□□□□□ -0.09
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PDE4D-204ENST00000358923 ONECUT1Q9UBC0 465 aa14.47□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 OR2T8A6NH00 312 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 RELBQ01201 579 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 Q0VG73 95 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 SSX8Q7RTT4 187 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF525Q8N782 197 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 SLC25A22Q9H936 323 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 TLN2Q9Y4G6 2542 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 SLC25A6P12236 298 aa14.46□□□□□ -0.09
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PDE4D-204ENST00000358923 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.46□□□□□ -0.09
PDE4D-204ENST00000358923 E7EUB6 86 aa14.46□□□□□ -0.1
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PDE4D-204ENST00000358923 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.46□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa14.45□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 FCN1O00602 326 aa14.45□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 TAX1BP3O14907 124 aa14.45□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 C3orf79P0CE67 100 aa14.45□□□□□ -0.1
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PDE4D-204ENST00000358923 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.45□□□□□ -0.1
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PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 J3QR06 171 aa14.45□□□□□ -0.1
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PDE4D-204ENST00000358923 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.44□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 C19orf35Q6ZS72 473 aa14.44□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 OR4S2Q8NH73 311 aa14.44□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 SFRP2Q96HF1 295 aa14.44□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 LINC00574Q9H8X3 128 aa14.44□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 GNB4Q9HAV0 340 aa14.44□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
PDE4D-204ENST00000358923 MLANAQ16655 118 aa14.43□□□□□ -0.1
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