RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284617.6

CCSAP-201, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-201ENST00000284617 FOXL1Q12952 345 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 APOMO95445 188 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 DOCK6Q96HP0 2047 aa17.51■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV21A0A0B4J279 112 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 VCX2Q9H322 139 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 CACNG7P62955 275 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP17.5■□□□□ 0.395e-10■■■□□ 17.7
CCSAP-201ENST00000284617 IGHV3-11P01762 117 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 HIST3H2BBQ8N257 126 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 ST20Q9HBF5 79 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 CLDN16Q9Y5I7 305 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 RHOGP84095 191 aa17.5■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 A0A1B0GV72 72 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM105Q8N8V8 129 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 NUP37Q8NFH4 326 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 OR5AN1Q8NGI8 311 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 PEMTQ9UBM1 199 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 TSPAN13O95857 204 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 COQ2Q96H96 371 aa17.49■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 DPM2O94777 84 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT11Q96G61 164 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 F2Z2F3 143 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 TIMM23O14925 209 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 ORMDL2Q53FV1 153 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM42Q69YG0 159 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01587Q99440 93 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 SPTBN2O15020 2390 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 H3BUT2 72 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 CLPSP04118 112 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 CXCL1P09341 107 aa17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 E9PLN8 166 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 CDKN1AP38936 164 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 VKORC1Q9BQB6 163 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 REG4Q9BYZ8 158 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 PSPNO60542 156 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 IGKV1-5P01602 117 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 CD7P09564 240 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 COLCA1Q6ZS62 124 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 CYSLTR1Q9Y271 337 aa17.47■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 THBDP07204 575 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 C10orf126Q8N4M7 172 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 OR10W1Q8NGF6 305 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 QRFPP83859 136 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01551Q86U37 167 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 PLAURQ03405 335 aa17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP17.46■□□□□ 0.39
CCSAP-201ENST00000284617 TGFAP01135 160 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 CNTFRP26992 372 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 NUDT10Q8NFP7 164 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01549A6NIU2 74 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 LINC01559Q495D7 138 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 AMBPP02760 352 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 RASL11AQ6T310 242 aa17.45■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 AGMATQ9BSE5 352 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 IL18BPO95998 194 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 Q6ZS49 121 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 TYMSP04818 313 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 CD24P25063 80 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 IFI27L1Q96BM0 104 aa17.44■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 TRAV5A0A0B4J249 113 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 LY96Q9Y6Y9 160 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 RNF5Q99942 180 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 OVOL1O14753 267 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 TNFSF13O75888 250 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 CA1P00915 261 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 LINC00469Q8N7U9 141 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 FAM169BQ8N8A8 192 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 WDR90Q96KV7 1748 aa17.43■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 KLHDC3Q9BQ90 382 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 PRSS22Q9GZN4 317 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 MS4A6AQ9H2W1 248 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 TOMM7Q9P0U1 55 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 TRGV2A0A075B6R0 118 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 LYNX1G3V0Z9 82 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 LYNX1P0DP58 116 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 FBLN7Q53RD9 439 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 ORAOV1Q8WV07 137 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 SLC25A2Q9BXI2 301 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 SMPXQ9UHP9 88 aa17.42■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 CD59P13987 128 aa17.41■□□□□ 0.38
CCSAP-201ENST00000284617 ZNF585BQ52M93 769 aa17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.8 ms