RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 C16orf97H3BN30 126 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 FOXH1O75593 365 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 LAGE3Q14657 143 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 DYNLRB2Q8TF09 96 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.35□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 SCN2AQ99250 2005 aa13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 RBMY1CP0DJD4 496 aa13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 CNTFRP26992 372 aa13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 C5orf67F2Z3F1 127 aa13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 ZNF138P52744 262 aa13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 C18orf32Q8TCD1 76 aa13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP13.34□□□□□ -0.27
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1-5P01602 117 aa13.34□□□□□ -0.27
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CTIF-201ENST00000256413 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 QRFPP83859 136 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 SHISA5Q8N114 240 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 CSRP2Q16527 193 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 NCR2O95944 276 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 FXYD7P58549 80 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 NRN1LQ496H8 165 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 TPRP12270 2363 aaKnown RBP13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1D-12P01611 117 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 PRCDQ00LT1 54 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 ZNF562Q6V9R5 426 aa13.33□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 F2Z2F3 143 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 YPEL1O60688 119 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 YPEL2Q96QA6 119 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 STRCQ7RTU9 1775 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 CCL25O15444 150 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 RHOGP84095 191 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 KIR2DL5AQ8N109 375 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 ARPC1AQ92747 370 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 ATP5G2Q06055 141 aa13.32□□□□□ -0.28
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CTIF-201ENST00000256413 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 PF4V1P10720 104 aa13.32□□□□□ -0.28
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CTIF-201ENST00000256413 TM4SF5O14894 197 aa13.32□□□□□ -0.28
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CTIF-201ENST00000256413 CSTL1Q9H114 145 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 S4R3C0 116 aa13.32□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 C9JAW5 83 aa13.31□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 FBXL15Q9H469 300 aa13.31□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.31□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 TRAV21A0A0B4J279 112 aa13.31□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa13.31□□□□□ -0.28
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CTIF-201ENST00000256413 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP13.31□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 TMEM101Q96IK0 257 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 C21orf62Q9NYP8 219 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PPM0 123 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 PPIFP30405 207 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 GGTLC3B5MD39 225 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 MORN2Q502X0 79 aa13.3□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 TAF1LQ8IZX4 1826 aa13.29□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-23P01764 117 aa13.29□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa13.29□□□□□ -0.28
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CTIF-201ENST00000256413 PVRIGQ6DKI7 326 aa13.29□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 IFITM1P13164 125 aa13.29□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 SLAQ13239 276 aa13.29□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 LYZL1Q6UWQ5 148 aa13.29□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 COX8AP10176 69 aa13.29□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 RRN3P1Q2M238 152 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 FAM106AQ4KMX7 169 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 TMEM190Q8WZ59 177 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 COL4A1P02462 1669 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 PCOLCEQ15113 449 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 TCRAP04437 139 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 ATG2BQ96BY7 2078 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 CFPP27918 469 aa13.28□□□□□ -0.28
CTIF-201ENST00000256413 C8orf46Q8TAG6 207 aa13.28□□□□□ -0.28
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