RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597576.1

ZNF548-208, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 2

Gene ZNF548, Length 659 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-208ENST00000597576 CXCL2P19875 107 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 VAMP2P63027 116 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 RHOGP84095 191 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 OR2C3Q8N628 320 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF680Q8NEM1 530 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 THAP6Q8TBB0 222 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 DCUN1D4Q92564 292 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 DPF1Q92782 380 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 C2orf50Q96LR7 162 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 RAB40CQ96S21 281 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 PRR13Q9NZ81 148 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 TNFSF18Q9UNG2 199 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.05□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 A0A0G2JRQ6 117 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 CCSO14618 274 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 BCL2L11O43521 198 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 TSC22D2O75157 780 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 PITX3O75364 302 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 ADAP1O75689 374 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 MPC2O95563 127 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 SCGB1D2O95969 90 aa6.04□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 OR8U8P0C7N1 319 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 APELAP0DMC3 54 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 AREGP15514 252 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 ZP3P21754 424 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 NPY1RP25929 384 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 TAS2R30P59541 319 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 RUNX1Q01196 453 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 WT1-ASQ06250 92 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 PRSS54Q6PEW0 395 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.04□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 SLC51BQ86UW2 128 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 MS4A10Q96PG2 267 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 TXN2Q99757 166 aa6.04□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 ARL6Q9H0F7 186 aa6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 RBKSQ9H477 322 aa6.04□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 TNCP24821 2201 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 SORL1Q92673 2214 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 A0A1W2PRX2 142 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 OR2J3O76001 311 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 IFNA4P05014 189 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 REG1AP05451 166 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 FABP1P07148 127 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 CD33P20138 364 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 OPRK1P41145 380 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 NPBWR1P48145 328 aa6.03□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 RAB14P61106 215 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 ID3Q02535 119 aa6.03□□□□□ -1.44
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ZNF548-208ENST00000597576 C15orf32Q32M92 178 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 C2orf83Q53S99 150 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 CLLU1Q5K131 121 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 Q6ZRM9 215 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 ZNF546Q86UE3 836 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 SCARB1Q8WTV0 552 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 MISP3Q96FF7 219 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 P2RX4Q99571 388 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 MBD2Q9UBB5 411 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.03□□□□□ -1.44
ZNF548-208ENST00000597576 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.02□□□□□ -1.45
ZNF548-208ENST00000597576 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.02□□□□□ -1.45
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