RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590422.1

CTIF-208, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-208ENST00000590422 ZNF124Q15973 351 aa8.94□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP8.94□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 UBAC2Q8NBM4 344 aa8.94□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.94□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 CD300LFQ8TDQ1 290 aa8.94□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 RNF183Q96D59 192 aa8.94□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 NAA60Q9H7X0 242 aa8.94□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 KRASP01116 189 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 LPAR6P43657 344 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 TRIM16LQ309B1 348 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 TMEM128Q5BJH2 165 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 KIR2DL5AQ8N109 375 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 OR5B3Q8NH48 314 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 RNF2Q99496 336 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.93□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 HERC2O95714 4834 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 OR4C46A6NHA9 309 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 UBE2CO00762 179 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 CYB5BO43169 146 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 IL5P05113 134 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 CTSGP08311 255 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 OR4E1P0C645 316 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 PPP1R1AQ13522 171 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 Q56UQ5 140 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 GALNT14Q96FL9 552 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 TP53RKQ96S44 253 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 MAP6D1Q9H9H5 199 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.92□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 C9orf170A2RU37 121 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 C15orf61A6NNL5 157 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 C15orf62A8K5M9 175 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 K7EMT4 169 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 DEDDO75618 318 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 B3GALNT1O75752 331 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 SFT2D2O95562 160 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 IGKV1-39P01597 117 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3-48P01763 117 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 IGKV1D-39P04432 117 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 OR5AC1P0C628 307 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 VAMP1P23763 118 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 UCP1P25874 307 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 DHRS2Q13268 280 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 SP6Q3SY56 376 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 STPG3Q8N7X2 389 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 GLYATL2Q8WU03 294 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 ATP6V0BQ99437 205 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 SMPXQ9UHP9 88 aa8.91□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 I3L2K1 104 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 CHEK1O14757 476 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 PRAF2O60831 178 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 SNAPC5O75971 98 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 TFPI2P48307 235 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 TMEM187Q14656 261 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 C4orf46Q504U0 113 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 OR1P1Q8NH06 330 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 MISP3Q96FF7 219 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 SEC22AQ96IW7 307 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 OR10C1Q96KK4 312 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 SEC22CQ9BRL7 303 aa8.9□□□□□ -0.98
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CTIF-208ENST00000590422 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.9□□□□□ -0.98
CTIF-208ENST00000590422 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.9□□□□□ -0.98
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CTIF-208ENST00000590422 A0A0B4J293 547 aa8.89□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 CDS2O95674 445 aa8.89□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 ANXA3P12429 323 aa8.89□□□□□ -0.99
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CTIF-208ENST00000590422 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 TMEM56Q96MV1 263 aa8.89□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa8.89□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 AGRNO00468 2067 aa8.89□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 C7orf66A4D0T2 115 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 SNRPGP15A8MWD9 76 aa8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
CTIF-208ENST00000590422 YIF1AO95070 293 aa8.88□□□□□ -0.99
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