RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545331.5

TULP3-208, Transcript of tubby like protein 3, human

TSL 2

Gene TULP3, Length 1,373 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TULP3-208	ENST00000545331	PRAF2	O60831	178 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	CTSG	P08311	255 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	SLC25A4	P12235	298 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	ID3	Q02535	119 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	MARC2	Q969Z3	335 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	GPN1	Q9HCN4	374 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	UFC1	Q9Y3C8	167 aa		13.99	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	ADM	P35318	185 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	OR4X1	Q8NH49	305 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		13.98	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	C2orf70	A6NJV1	201 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	MPTX1	A8MV57	137 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	RAB11A	P62491	216 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		13.97	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF320	A2RRD8	509 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	CLN5	O75503	358 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	ZBTB8B	Q8NAP8	495 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		13.96	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
TULP3-208	ENST00000545331	INMT-MINDY4	F8WBC2	141 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331		K7EMT4	169 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	WRB	O00258	174 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	TMEM50A	O95807	157 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	IGHV3-48	P01763	117 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	IFNA4	P05014	189 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	IAPP	P10997	89 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	FOLR2	P14207	255 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	CD69	Q07108	199 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	UNQ9165/PRO28630	Q6UXU0	137 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	DYNLRB2	Q8TF09	96 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	CBLN1	P23435	193 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	MRAP	Q8TCY5	172 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.95	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	PTTG1	O95997	202 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	SPN	P16150	400 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	C11orf87	Q6NUJ2	197 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.94	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	WI2-2373I1.2	A0A1W2PRP0	233 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331		K7EIL1	84 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	GP9	P14770	177 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	MLANA	Q16655	118 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	RAB40C	Q96S21	281 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	C5orf51	A6NDU8	294 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	CCS	O14618	274 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	RND2	P52198	227 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	TAS2R30	P59541	319 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	TM4SF20	Q53R12	229 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	SMIM8	Q96KF7	97 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	C2orf50	Q96LR7	162 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	PRR25	Q96S07	402 aa		13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	SSSCA1	O60232	199 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	SCGB1D2	O95969	90 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	IGLC1	P0CG04	106 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	ZNF414	Q96IQ9	312 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	SLC35E1	Q96K37	410 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		13.91	□□□□□ -0.18
TULP3-208	ENST00000545331	PSENEN	Q9NZ42	101 aa		13.91	□□□□□ -0.18

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