RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	NAGK	Q9UJ70	344 aa		12.68	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	12.68	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV2-26	A0A0B4J1V2	119 aa		12.68	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	TDRG1	Q3Y452	100 aa		12.68	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM177	Q53S58	311 aa		12.68	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		12.68	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		12.68	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		12.68	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		12.68	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193		M0R143	59 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	FOXL1	Q12952	345 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	PDPN	Q86YL7	162 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM122A	Q96E09	287 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	HINT2	Q9BX68	163 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	CHODL	Q9H9P2	273 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	ENY2	Q9NPA8	101 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	CD99	P14209	185 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	TNFRSF14	Q92956	283 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	TBX15	Q96SF7	602 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	12.67	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193		A6NNC1	897 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	PRSS46	E5RG02	174 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	FOXH1	O75593	365 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV1-47	P01700	117 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	RBP4	P02753	201 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF90	Q03938	601 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	UBTD1	Q9HAC8	227 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	STAG3L2	P0CL84	134 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	STAG3L3	P0CL85	134 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	CDKN1A	P38936	164 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	PRRX1	P54821	245 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	ERVFC1-1	P60608	527 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	PRCD	Q00LT1	54 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	C22orf46	C9J442	243 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193		F2Z2F3	143 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193		K7EN84	100 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	OPRK1	P41145	380 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	LIPF	P07098	398 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	NPY1R	P25929	384 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	C1orf159	Q96HA4	380 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	PLEKHA3	Q9HB20	300 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GRSF1-208	ENST00000545193	SPINK4	O60575	86 aa		12.65	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	CXorf1	O96002	111 aa		12.65	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	CA2	P00918	260 aa		12.65	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	IGFBP2	P18065	325 aa		12.65	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	MC5R	P33032	325 aa		12.65	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	12.65	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6ZWC4	215 aa		12.65	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	OR5B3	Q8NH48	314 aa		12.65	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		12.65	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFS7	O75251	213 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	ACTL6B	O94805	426 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00310	P59036	64 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	OR5I1	Q13606	314 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	COX7A1	P24310	79 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	OR10J1	P30954	320 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE1	Q13065	139 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	ACACB	O00763	2458 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	TNC	P24821	2201 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	SERF1A	O75920	110 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV2-23	P01705	113 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	GCHFR	P30047	84 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	MPDU1	O75352	247 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	IER3	P46695	156 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	RITA1	Q96K30	269 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		12.62	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		12.62	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		12.62	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	ENSA	O43768	121 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00614	P0C842	121 aa		12.62	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	CRISP2	P16562	243 aa		12.62	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	12.62	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		12.62	□□□□□ -0.39
GRSF1-208	ENST00000545193	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		12.62	□□□□□ -0.39

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