RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535976.1

CLIP1-AS1-201, CLIP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CLIP1-AS1, Length 1,745 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 WASHC3Q9Y3C0 194 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.53□□□□□ -1.68
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A0A1B0GU03 582 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LINC00473A8K010 186 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 A8MWP6 167 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CLDN34H7C241 214 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KRASP01116 189 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLV1-47P01700 117 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGLV2-14P01704 120 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CT45A6P0DMU7 189 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CT45A5P0DMU8 189 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CT45A7P0DMV0 189 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXCL3P19876 107 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C4BPBP20851 252 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 APCP25054 2843 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 REG1BP48304 166 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF137PP52743 207 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RAB5BP61020 215 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPL30P62888 115 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RPL32P62910 135 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PAX2Q02962 417 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KLRD1Q13241 179 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HES1Q14469 280 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 Q6ZSN1 163 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDPNQ86YL7 162 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ODF3L1Q8IXM7 274 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PDZD9Q8IXQ8 264 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TCTE3Q8IZS6 198 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC35G3Q8N808 338 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR11H7Q8NGC8 314 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR2T35Q8NGX2 323 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MALSU1Q96EH3 234 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NABP2Q9BQ15 211 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FKBP11Q9NYL4 201 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HILPDAQ9Y5L2 63 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VPS13CQ709C8 3753 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ABCA12Q86UK0 2595 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NPFFO15130 113 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NBR2O15453 112 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR2A4O95047 310 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 S1PR2O95136 353 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CNIH1O95406 144 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MT-CO2P00403 227 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV1-69P01742 117 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SPP1P10451 314 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SLC25A6P12236 298 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MMP9P14780 707 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 G6PCP35575 357 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 S100A10P60903 97 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PLGLAQ15195 96 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 VMA21Q3ZAQ7 101 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 UTF1Q5T230 341 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 BAP18Q8IXM2 172 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR4P4Q8NGL7 312 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C2CD4CQ8TF44 421 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 HYLS1Q96M11 299 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 OR2A7Q96R45 310 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TBX15Q96SF7 602 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 RNF5Q99942 180 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ENY2Q9NPA8 101 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 KIAA1456Q9P272 454 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PEMTQ9UBM1 199 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZFP30Q9Y2G7 519 aa4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 TRAV40A0A0B4J280 105 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C20orf202A1L168 122 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ODF3BA8MYP8 253 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 SEC14L6B5MCN3 397 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 H0YJW9 148 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PPP1R2P9O14990 202 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 FAM106CPP0CH98 169 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 DLX1P56177 255 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 PSG5Q15238 335 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 ZNF585BQ52M93 769 aa4.51□□□□□ -1.69
CLIP1-AS1-201ENST00000535976 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
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