RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532474.5

RCN1-208, Transcript of reticulocalbin 1, human

TSL 3

Gene RCN1, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RCN1-208	ENST00000532474	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	C20orf24	Q9BUV8	137 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	HIPK2	Q9H2X6	1198 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	ENY2	Q9NPA8	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474		A0A0B4J293	547 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	IGHV3-35	A0A0C4DH35	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474		I3L2K1	104 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	UBE2C	O00762	179 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CTDSPL	O15194	276 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	GNG7	O60262	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	MT-CO2	P00403	227 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	IFNA17	P01571	189 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	IGKV1-39	P01597	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	IGKV1D-39	P04432	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CTSG	P08311	255 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474		P0C879	139 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	EDN2	P20800	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	UCP1	P25874	307 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	NPBWR1	P48145	328 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	APOC4	P55056	127 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RNASE12	Q5GAN4	147 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SLC35G3	Q8N808	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	OR10C1	Q96KK4	312 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	PRRT1	Q99946	306 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	GINS3	Q9BRX5	216 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CCDC59	Q9P031	241 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	TEX13D	A0A0J9YY54	714 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CTDSP2	O14595	271 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	ST8SIA3	O43173	380 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	YIF1A	O95070	293 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CDS2	O95674	445 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	IGKV1-5	P01602	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RPL5	P46777	297 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	HOXA1	P49639	335 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	PPP5C	P53041	499 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SPCS3	P61009	180 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	DHODH	Q02127	395 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	IL18	Q14116	193 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	FHL2	Q14192	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SPCS2	Q15005	226 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	AARD	Q4LEZ3	155 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474		Q6ZWC4	215 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RBPMS	Q93062	196 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	TMEM222	Q9H0R3	208 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SMPX	Q9UHP9	88 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	LCE6A	A0A183	80 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	CHEK1	O14757	476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	GSTZ1	O43708	216 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	OPRK1	P41145	380 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	ETV6	P41212	452 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	HTR2B	P41595	481 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	SP6	Q3SY56	376 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RCN1-208	ENST00000532474	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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