RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529978.1

KIAA1456-208, Transcript of Probable tRNA methyltransferase 9-like protein, human

TSL 1 (best)

Gene KIAA1456, Length 6,003 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIAA1456-208	ENST00000529978	VAMP3	Q15836	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	PCM1	Q15154	2024 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	NIN	Q8N4C6	2090 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978		H3BUX3	64 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	PTBP3	O95758	552 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	IGLV1-44	P01699	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	CCL3L1	P16619	93 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	MST1	P26927	711 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	RPL15	P61313	204 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	OR1N2	Q8NGR9	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	TCF15	Q12870	199 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	RTN4R	Q9BZR6	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	HIVEP2	P31629	2446 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	PEX7	O00628	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	INS	P01308	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	FOXF2	Q12947	444 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	RPL39P5	Q59GN2	51 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	DYRK2	Q92630	601 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	SMIM12	Q96EX1	92 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	TDGF1	P13385	188 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	APOC4	P55056	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	NXT2	Q9NPJ8	142 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	NIT2	Q9NQR4	276 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	CBY3	A6NI87	242 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	CRP	P02741	224 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	ICAM4	Q14773	271 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	PSPN	O60542	156 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	NDUFB4	O95168	129 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	SRI	P30626	198 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	MRPL54	Q6P161	138 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	RFLNB	Q8N5W9	214 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	RGP1	Q92546	391 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978		U3KQA8	63 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KIAA1456-208	ENST00000529978	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	OR11H1	Q8NG94	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	OR11H2	Q8NH07	326 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	PHOX2A	O14813	284 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	EFNA2	O43921	213 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	FABP4	P15090	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	PARD6G	Q9BYG4	376 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	OSTC	Q9NRP0	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	SDK2	Q58EX2	2172 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	SPTB	P11277	2137 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	CCL20	P78556	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	PLSCR3	Q9NRY6	295 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	CELA3B	P08861	270 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	NUDT11	Q96G61	164 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	VGLL1	Q99990	258 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978		E7EQL1	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KIAA1456-208	ENST00000529978	SAP30	O75446	220 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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