RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496574.6

PKD1-222, Transcript of polycystin 1, transient receptor potential channel interacting, human

TSL 5

Gene PKD1, Length 4,419 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PKD1-222	ENST00000496574	SIGMAR1	Q99720	223 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	MGST2	Q99735	147 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	NCOR1	O75376	2440 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	TRBV20OR9-2	A0A075B6H5	130 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	FOXF2	Q12947	444 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	RASL11A	Q6T310	242 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	UNQ5830/PRO19650/PRO19816	Q6UY13	95 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	MORN2	Q502X0	79 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574		Q9H3A6	140 aa		11.78	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	UPK2	O00526	184 aa		11.77	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	PSG1	P11464	419 aa		11.77	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	CD69	Q07108	199 aa		11.77	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	PMS2CL	Q68D20	193 aa		11.77	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574		Q6ZT83	130 aa		11.77	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574		Q6ZWC4	215 aa		11.77	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.52
PKD1-222	ENST00000496574	hDV102S1	A0JD36	115 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	GP6	Q9HCN6	339 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	GAGE12B	A1L429	117 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	IGLC2	P0DOY2	106 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	IGLC3	P0DOY3	106 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	PSG9	Q00887	426 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	HSD52	Q0P140	79 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	MUC21	Q5SSG8	566 aa		11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CIART	Q8N365	385 aa	Predicted RBP	11.77	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	ATP5L	O75964	103 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	COX6C	P09669	75 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF524	Q96C55	264 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	FOXC2	Q99958	501 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574		A0A1W2PS18	150 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	ITGB1BP1	O14713	200 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	MFAP4	P55083	255 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CACNG7	P62955	275 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	EPOP	A6NHQ4	379 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	C15orf62	A8K5M9	175 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CELA3B	P08861	270 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF585B	Q52M93	769 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.76	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	PI4KA	P42356	2102 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574		A0A087X0K7	114 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	C16orf97	H3BN30	126 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CECR9	P0C854	216 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574		M0QZ24	198 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	HBD	P02042	147 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	NTF4	P34130	210 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	YPEL3	P61236	119 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	PSPN	O60542	156 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	FOXH1	O75593	365 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CD3E	P07766	207 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	GFRA1	P56159	465 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	PRCD	Q00LT1	54 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	CFHR1	Q03591	330 aa		11.75	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	WISP1	O95388	367 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	TFF1	P04155	84 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	C1orf210	Q8IVY1	113 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	TEX45	Q8NA69	505 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	NLRC5	Q86WI3	1866 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	AHRR	A9YTQ3	701 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	TDGF1	P13385	188 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	FAM201A	Q5SY85	155 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	WDR82	Q6UXN9	313 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	OR9G4	Q8NGQ1	327 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.74	□□□□□ -0.53
PKD1-222	ENST00000496574	POLE	Q07864	2286 aa		11.74	□□□□□ -0.53

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