RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 PRR20CP86479 221 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 PRR20DP86480 221 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 PRR20BP86481 221 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 PRR20AP86496 221 aa10.42□□□□□ -0.74
PRAME-213ENST00000492657 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.42□□□□□ -0.74
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PRAME-213ENST00000492657 C19orf35Q6ZS72 473 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-213ENST00000492657 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa10.37□□□□□ -0.75
PRAME-213ENST00000492657 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
PRAME-213ENST00000492657 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP10.37□□□□□ -0.75
PRAME-213ENST00000492657 KAAG1Q9UBP8 84 aa10.37□□□□□ -0.75
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