RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490236.2

RAB18-206, Transcript of RAB18, member RAS oncogene family, human

TSL 5

Gene RAB18, Length 730 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB18-206	ENST00000490236	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	PVALB	P20472	110 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	VAMP2	P63027	116 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	ZNF502	Q8TBZ5	544 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	PINX1	Q96BK5	328 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	MCRIP2	Q9BUT9	160 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	FBN3	Q75N90	2809 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RAB18-206	ENST00000490236	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236		H3BP45	60 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	MPC2	O95563	127 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	IFNA4	P05014	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	OPRK1	P41145	380 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	MFAP4	P55083	255 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	BEAN1	Q3B7T3	259 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	CCDC140	Q96MF4	163 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	TXN2	Q99757	166 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236		S4R3C0	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	IGHV3-21	A0A0B4J1V1	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	PMS2P5	A8MQ11	134 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	PRSS46	E5RG02	174 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236		E5RGE8	158 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236		F8W735	103 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236		H0YIZ8	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	BMPR1B	O00238	502 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	OVOL1	O14753	267 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	IGHV3-23	P01764	117 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	PET100	P0DJ07	73 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	ZP3	P21754	424 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	RAP2B	P61225	183 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	CD69	Q07108	199 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	MLANA	Q16655	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	LRRC37A5P	Q49AS3	106 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	RNF126	Q9BV68	326 aa		11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	CLEC3B	P05452	202 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	SLC25A4	P12235	298 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	LYL1	P12980	280 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	P2RY1	P47900	373 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	GPR61	Q9BZJ8	451 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	SEC14L6	B5MCN3	397 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	PPP5D1	E7EU14	171 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	WIPF1	O43516	503 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	IGHV3-48	P01763	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	BCAP31	P51572	246 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	FGL1	Q08830	312 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	ACSM6	Q6P461	480 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	SPSB3	Q6PJ21	355 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	OR4X1	Q8NH49	305 aa		11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	FAM24A	A6NFZ4	105 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	TGOLN2	O43493	480 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	GGCT	O75223	188 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	METTL15P1	P0C7V9	234 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	GPR183	P32249	361 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	ARL3	P36405	182 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	NPBWR1	P48145	328 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	CAV2	P51636	162 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	RPEL1	Q2QD12	228 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236		Q56UQ5	140 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	HAPLN4	Q86UW8	402 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	TMEM252	Q8N6L7	170 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	THAP6	Q8TBB0	222 aa		11.1	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	IGSF23	A1L1A6	192 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	OR2T8	A6NH00	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	FNDC10	F2Z333	226 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	GNG7	O60262	68 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	CLN5	O75503	358 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	CCNK	O75909	580 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	OR2C1	O95371	312 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	CTSG	P08311	255 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	SYNJ2BP	P57105	145 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	GAMT	Q14353	236 aa		11.09	□□□□□ -0.63
RAB18-206	ENST00000490236	OR8G2P	Q6IF36	304 aa		11.09	□□□□□ -0.63

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