RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IGFBP2P18065 325 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPY1RP25929 384 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GATA4P43694 442 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VWC2Q2TAL6 325 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAT1Q6PIZ9 186 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 Q6ZN92 141 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4P4Q8NGL7 312 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR4S2Q8NH73 311 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ELOVL5Q9NYP7 299 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIAL4EA0A075B759 164 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIAL4DF5H284 164 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPIAL4FP0DN26 164 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CFHR2P36980 270 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C20orf144Q9BQM9 153 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CSTL1Q9H114 145 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM106BQ9NUM4 274 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPINK4O60575 86 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CGB3P0DN86 165 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CGB7P0DN87 165 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VAMP3Q15836 100 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STPG3Q8N7X2 389 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC24A4Q8NFF2 622 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NUP37Q8NFH4 326 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BTF3L4Q96K17 158 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF2Q99496 336 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SELENOKQ9Y6D0 94 aa12.63□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TNFRSF1AP19438 455 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM200BQ69YZ2 307 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SGMS2Q8NHU3 365 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F6UZH7 168 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM178BH3BS89 294 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC17A3O00476 420 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOSR1O95249 250 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ADORA2A-AS1P86434 159 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ASPHD1Q5U4P2 390 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM222BQ8WU58 562 aa12.62□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSBP1L1C9JCN9 74 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 F2RL2O00254 374 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IL3RAP26951 378 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KRTDAPP60985 99 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPL19P84098 196 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FBLN7Q53RD9 439 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VKORC1Q9BQB6 163 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PRD5 423 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PRF3 423 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PRM7 423 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 UQCRFS1P47985 274 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ACTL10Q5JWF8 245 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR10W1Q8NGF6 305 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CMTM2Q8TAZ6 248 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NPVFQ9HCQ7 196 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR51B2Q9Y5P1 312 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa12.61□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C15orf61A6NNL5 157 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CD3EP07766 207 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR10J4P0C629 311 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KCNIP4Q6PIL6 250 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ORAOV1Q8WV07 137 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf159Q96HA4 380 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 J3QR06 171 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OPRK1P41145 380 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EFNB3Q15768 340 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C10orf55Q5SWW7 151 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TEPPQ6URK8 271 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MIR17HGQ75NE6 70 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf174Q8IYL3 243 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OCC1Q8TAD7 63 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANAPC16Q96DE5 110 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IMMP2LQ96T52 175 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDE6DO43924 150 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C19orf35Q6ZS72 473 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF738Q8NE65 137 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RITA1Q96K30 269 aa12.6□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A1W2PN81 502 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CT45A6P0DMU7 189 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CT45A5P0DMU8 189 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CT45A7P0DMV0 189 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 LGALS4P56470 323 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ATOH7Q8N100 152 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC35D1Q9NTN3 355 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF462Q96JM2 2506 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 USP24Q9UPU5 2620 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STAG3L2P0CL84 134 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 STAG3L3P0CL85 134 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC35B1P78383 322 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MUC15Q8N387 334 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DDB2Q92466 427 aa12.59□□□□□ -0.39
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 OR7C2O60412 319 aa12.58□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms