RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, human

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SZRD1-208	ENST00000476423	HTR1D	P28221	377 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	OR3A4P	P47883	348 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	RAB7A	P51149	207 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	VAMP2	P63027	116 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	OR5I1	Q13606	314 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	LYPD6	Q86Y78	171 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	MAPKAPK5-AS1	Q8N8E1	139 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	LRTM2	Q8N967	370 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF738	Q8NE65	137 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	LEAP2	Q969E1	77 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	COQ2	Q96H96	371 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	RAX2	Q96IS3	184 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	SNX22	Q96L94	193 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	OR5B12	Q96R08	314 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	TP53RK	Q96S44	253 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	PKIB	Q9C010	78 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	HHLA2	Q9UM44	414 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423		R4GMQ9	66 aa		6.1	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A1B0GVY2	172 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A1W2PPI3	338 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	hADV38S2	A0JD32	116 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423		K7ERU9	68 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	IFNA1	P01562	189 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	IGKV1D-12	P01611	117 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	MAS1	P04201	325 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	ESD	P10768	282 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	SCGB1A1	P11684	91 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	RAB11A	P62491	216 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC35B1	P78383	322 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	BAX	Q07812	192 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	KIR2DS1	Q14954	304 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	TEX38	Q6PEX7	206 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423		Q6ZSR3	168 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	TCF24	Q7RTU0	167 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	LHFPL1	Q86WI0	220 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	C5orf56	Q8N8D9	126 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	OR5B3	Q8NH48	314 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	CSTL1	Q9H114	145 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	DPM3	Q9P2X0	92 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	DHDH	Q9UQ10	334 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SZRD1-208	ENST00000476423	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	CBY3	A6NI87	242 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	LY6L	H3BQJ8	138 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	PITX3	O75364	302 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	SCGB1D1	O95968	90 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	HRH1	P35367	487 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	S100A10	P60903	97 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	RND3	P61587	244 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	SRPX	P78539	464 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	KCNIP4	Q6PIL6	250 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	OR5D18	Q8NGL1	313 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	SPACA5	Q96QH8	159 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	SLC45A2	Q9UMX9	530 aa		6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	LOC102723971	A0A1B0GUV8	181 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	ODAM	A1E959	279 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	TMEM238	C9JI98	176 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423		J3QR06	171 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	HSPB6	O14558	160 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	MGST3	O14880	152 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	CDK2AP2	O75956	126 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	OR2H2	O95918	312 aa		6.07	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	6.07	□□□□□ -1.44
SZRD1-208	ENST00000476423	UCP1	P25874	307 aa		6.07	□□□□□ -1.44

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