RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462256.5

DDX39B-215, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 2

Gene DDX39B, Length 4,027 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-215ENST00000462256 ELANEP08246 267 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 SFTA3P0C7M3 94 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 UCP3P55916 312 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 PPP1R1AQ13522 171 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 WNT10AQ9GZT5 417 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 S4R3C0 116 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 FLNCQ14315 2725 aa7.47□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 ITGB1BP1O14713 200 aa7.46□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 CD37P11049 281 aa7.46□□□□□ -1.21
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DDX39B-215ENST00000462256 IER3P46695 156 aa7.46□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 BLCAPP62952 87 aa7.46□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 PRSS8Q16651 343 aa7.46□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 Q6YL49 198 aa7.46□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa7.46□□□□□ -1.21
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1B0GU03 582 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP7.46□□□□□ -1.22
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DDX39B-215ENST00000462256 RBX1P62877 108 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 ANKRD55Q3KP44 614 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 CABLES2Q9BTV7 478 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 SELENOKQ9Y6D0 94 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV3-23P01764 117 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 ANOS1P23352 680 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 NPPCP23582 126 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 RHOBP62745 196 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 GGNBP1Q5YKI7 109 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 C2orf50Q96LR7 162 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 DOK5Q9P104 306 aa7.46□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1W2PPQ1 181 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 BMPR1BO00238 502 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 ID1P41134 155 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 LY6G5BQ8NDX9 201 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 USMG5Q96IX5 58 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 MDKP21741 143 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP7.45□□□□□ -1.221e-6■□□□□ 11.3
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DDX39B-215ENST00000462256 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 TMEM222Q9H0R3 208 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 A0A1B0GW15 77 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 LINC00614P0C842 121 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 DHRS2Q13268 280 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 KHDC3LQ587J8 217 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 Q6ZSR3 168 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 HRH4Q9H3N8 390 aa7.45□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 C9JQL5 133 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 ATP6V0E1O15342 81 aa7.44□□□□□ -1.22
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DDX39B-215ENST00000462256 FABP4P15090 132 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 RND2P52198 227 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 CEBPGP53567 150 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 LYZL2Q7Z4W2 148 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 NECAP1Q8NC96 275 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 UPK2O00526 184 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 CST7O76096 145 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 SLC25A4P12235 298 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 HERPUD1Q15011 391 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 C1orf159Q96HA4 380 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 A0A0D9SG52 128 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 BCL2L11O43521 198 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 TAS2R45P59539 299 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 ZNF266Q14584 549 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 UFC1Q9Y3C8 167 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.44□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 G3V318 75 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 GGCTO75223 188 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 CDS2O95674 445 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 AVPP01185 164 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 CD74P04233 296 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 RPS10P46783 165 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 GALR1P47211 349 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 KCNRGQ8N5I3 272 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 IGFBPL1Q8WX77 278 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 E5RGE8 158 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 C15orf65H3BRN8 121 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 IGHV3-48P01763 117 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 C15orf32Q32M92 178 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 AWAT1Q58HT5 328 aa7.43□□□□□ -1.22
DDX39B-215ENST00000462256 C10orf55Q5SWW7 151 aa7.43□□□□□ -1.22
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