RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 PCNX1Q96RV3 2341 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 K7ENP7 123 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 DDTP30046 118 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 APC2O95996 2303 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 FSTL3O95633 263 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 IGHV3-48P01763 117 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 LGALS7P47929 136 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 PPOXP50336 477 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 OR5AU1Q8NGC0 362 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 OSTCQ9NRP0 149 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 PKDREJQ9NTG1 2253 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 B9A039 149 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TIGITQ495A1 244 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF664Q8N3J9 261 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 VKORC1Q9BQB6 163 aa12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 PVRIGQ6DKI7 326 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 OR1L6Q8NGR2 347 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 IGLC7A0M8Q6 106 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 GRIFINA4D1Z8 144 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 PLAUP00749 431 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 REG1AP05451 166 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 FOXC1Q12948 553 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 C10orf113Q5VZT2 155 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 OR8I2Q8N0Y5 310 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 KALRNO60229 2985 aa12.87□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ISLRO14498 428 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 COX7A2P2O60397 106 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 PYYP10082 97 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 DLX1P56177 255 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RBPJQ06330 500 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 OR1L4Q8NGR5 311 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ENSAO43768 121 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 IGLV1-47P01700 117 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CRYGCP07315 174 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CRYGBP07316 175 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 LINC00310P59036 64 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TEX45Q8NA69 505 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TNFRSF14Q92956 283 aa12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP12.86□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CD3EP07766 207 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 IER3P46695 156 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SSX2Q16385 188 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF841Q6ZN19 808 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MUC6Q6W4X9 2439 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 MFAP2P55001 183 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CX3CL1P78423 397 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 REC114Q7Z4M0 266 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 PAXXQ9BUH6 204 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa12.85□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 C22orf46C9J442 243 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 LYNX1G3V0Z9 82 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 FCN1O00602 326 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 LYNX1P0DP58 116 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CNTFRP26992 372 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 BPIFB3P59826 476 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 FXYD3Q14802 87 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 LINC00479Q96M42 142 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SCNM1Q9BWG6 230 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 GNB1LQ9BYB4 327 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 DCHS1Q96JQ0 3298 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 A8MWP6 167 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 FAM87AP0C7U9 286 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TAS2R60P59551 318 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 HCP5Q6MZN7 132 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 FXYD5Q96DB9 178 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 NAV3Q8IVL0 2385 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SNURFLB1AK76 121 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 ESDP10768 282 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RAB4BP61018 213 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 LINC01560Q8TB33 94 aa12.84□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 CRISP2P16562 243 aa12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 IQCJQ1A5X6 159 aa12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 ZNF329Q86UD4 541 aa12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 C19orf35Q6ZS72 473 aa12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 LINC00305Q7Z4B0 112 aa12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 CMTM2Q8TAZ6 248 aa12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
SHQ1-202ENST00000444040 SIGLEC9Q9Y336 463 aa12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms