RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 HINT2Q9BX68 163 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 S4R3C0 116 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 ST8SIA3O43173 380 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 SAP30O75446 220 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 ATG12O94817 140 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 AKR1C4P17516 323 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 INSL3P51460 131 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 AKR1C2P52895 323 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPEL1Q2QD12 228 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPINK9Q5DT21 86 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 C10orf25Q5T742 122 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM268Q5VZI3 342 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLEC19AQ6UXS0 136 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 HAPLN4Q86UW8 402 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 SGPP2Q8IWX5 399 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR2C3Q8N628 320 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 MRAPQ8TCY5 172 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR146Q96CH1 333 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM56Q96MV1 263 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa5.66□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 NOTCH3Q9UM47 2321 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 INS-IGF2F8WCM5 200 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 K7EIM0 57 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR2C1O95371 312 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 CSN3P07498 182 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL7P13232 177 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 BTCP35070 178 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 ARL3P36405 182 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCR6P51684 374 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 AARDQ4LEZ3 155 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM209BQ5JX69 171 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRIQKQ629K1 86 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC25A24Q6NUK1 477 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMED4Q7Z7H5 227 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM219AQ8IW50 185 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC35G3Q8N808 338 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF114Q8NC26 417 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR1P1Q8NH06 330 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZNF502Q8TBZ5 544 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 IL22RA2Q969J5 263 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 CXorf58Q96LI9 332 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 ELOVL1Q9BW60 279 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLEKHA3Q9HB20 300 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 THYN1Q9P016 225 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 CACNG5Q9UF02 275 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.65□□□□□ -1.5
RNU1-38P-201ENST00000362817 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 I3L2K1 104 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CYB5BO43169 146 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 GGCTO75223 188 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 IFNA17P01571 189 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGLV1-51P01701 117 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLEC3BP05452 202 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPNP16150 400 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 EDN2P20800 178 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPR183P32249 361 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 INPP1P49441 399 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 TATDN3Q17R31 274 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANKRD55Q3KP44 614 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 NMSQ5H8A3 153 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 PVRIGQ6DKI7 326 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 GPHB5Q86YW7 130 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR52E5Q8NH55 327 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 VN1R17PQ8TDU5 208 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR4C12Q96R67 309 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A0B4J2A0 478 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 OR2T8A6NH00 312 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 LGALS9O00182 355 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 PLA2G10O15496 165 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 NDUFB6O95139 128 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SFT2D2O95562 160 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ANXA3P12429 323 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPCS3P61009 180 aa5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 ERHP84090 104 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPP1R1AQ13522 171 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms