RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 SCGB1D1O95968 90 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10J1P30954 320 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 C1orf194Q5T5A4 169 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 PNKDQ8N490 385 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10W1Q8NGF6 305 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 UCNP55089 124 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 MS4A10Q96PG2 267 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 NAGKQ9UJ70 344 aa15.2■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 H0YJW9 148 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC17A3O00476 420 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 C19orf24Q9BVV8 132 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5G3P0C626 314 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 ESDP10768 282 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 UQCRFS1P47985 274 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 REG1BP48304 166 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 LGALS4P56470 323 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5AN1Q8NGI8 311 aa15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 APOA2P02652 100 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CBLN1P23435 193 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 ERVFC1-1P60608 527 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CD69Q07108 199 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM200BQ69YZ2 307 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 PQLC2Q6ZP29 291 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 OR9G1Q8NH87 305 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 HARBI1Q96MB7 349 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF714Q96N38 554 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 FAM208BQ5VWN6 2430 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM177Q53S58 311 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CMTM2Q8TAZ6 248 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 GRIFINA4D1Z8 144 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 LINC00310P59036 64 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 HELTA6NFD8 242 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CRYBB3P26998 211 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 PAFAH1B2P68402 229 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 KIR2DL5AQ8N109 375 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 V9GYV3 84 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 INS-IGF2F8WCM5 200 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CD3EP07766 207 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CACNG8Q8WXS5 425 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 COMMD5Q9GZQ3 224 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM106BQ9NUM4 274 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CTSZQ9UBR2 303 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CHRNB4P30926 498 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 RPL8P62917 257 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CENPWQ5EE01 88 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 E7EUB6 86 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM178BH3BS89 294 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 OR7C2O60412 319 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 OR5I1Q13606 314 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 SLC25A33Q9BSK2 321 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CELSR2Q9HCU4 2923 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIAL4EA0A075B759 164 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 PSMB11A5LHX3 300 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIAL4DF5H284 164 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIAL4FP0DN26 164 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 CRISP2P16562 243 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 GNG4P50150 75 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 TAS2R45P59539 299 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 RPEL1Q2QD12 228 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 MMD2Q8IY49 270 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 PPIAL4AQ9Y536 164 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 USP24Q9UPU5 2620 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 GGTLC3B5MD39 225 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 EREGO14944 169 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 OR10J4P0C629 311 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 USF1P22415 310 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP1-201ENST00000357436 C8orf88P0DMB2 117 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 TPPP2P59282 170 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 Q6ZWC4 215 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF596Q8TC21 504 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 Q0VG73 95 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 OR4C13Q8NGP0 309 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2T6Q8NHC8 308 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 A0A1W2PRE2 83 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 MUC15Q8N387 334 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 IGFBPL1Q8WX77 278 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 SNHG12Q9BXW3 62 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 GNB1LQ9BYB4 327 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 NGBQ9NPG2 151 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP1-201ENST00000357436 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.2 ms