RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 Q6ZT83 130 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 LYG1Q8N1E2 194 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 MUC15Q8N387 334 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF738Q8NE65 137 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 SCNM1Q9BWG6 230 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 ENY2Q9NPA8 101 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 TUBG2Q9NRH3 451 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 BET1LQ9NYM9 111 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 CALYQ9NYX4 217 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 FZR1Q9UM11 496 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 OR51B2Q9Y5P1 312 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 TNCP24821 2201 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 AGFG2O95081 481 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 C8orf88P0DMB2 117 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 GUSBP1Q15486 140 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 NUP35Q8NFH5 326 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 OR9G1Q8NH87 305 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 LEAP2Q969E1 77 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 GCM1Q9NP62 436 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 SPTBN2O15020 2390 aa6.91□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 HSBP1O75506 76 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 CECR9P0C854 216 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 FABP6P51161 128 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 UBE2G1P62253 170 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 ARG2P78540 354 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 C2orf83Q53S99 150 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 KIR3DL3Q8N743 410 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 LINC00479Q96M42 142 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 SAP30LQ9HAJ7 183 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 PRNDQ9UKY0 176 aa6.9□□□□□ -1.3
UBQLN3-201ENST00000311659 VWC2LB2RUY7 222 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 J3QR06 171 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 M0R2Z0 102 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 CFHR2P36980 270 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 MFAP2P55001 183 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 Q56UQ5 140 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 GCSAMQ8N6F7 178 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNRF1Q8ND25 227 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 OR2V2Q96R30 315 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 DYSFO75923 2080 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 NBEAQ8NFP9 2946 aa6.9□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 TRAV5A0A0B4J249 113 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 A0A1B0GXF2 115 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 A0A1W2PN81 502 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 UPK2O00526 184 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 CRXO43186 299 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 KLK10O43240 276 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 IGLV1-44P01699 117 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 CD69Q07108 199 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 MLANAQ16655 118 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 FBLN7Q53RD9 439 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 NUDT11Q96G61 164 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 ADTRPQ96IZ2 230 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF714Q96N38 554 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 HINT2Q9BX68 163 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 C1RLQ9NZP8 487 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 CACNA1GO43497 2377 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 TNFSF4P23510 183 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 MSMPQ1L6U9 139 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF329Q86UD4 541 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 OR1L8Q8NGR8 309 aa6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
UBQLN3-201ENST00000311659 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.88□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms