RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 PRR20DP86480 221 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PRR20BP86481 221 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PRR20AP86496 221 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PET117Q6UWS5 81 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 GPR82Q96P67 336 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PRDM13Q9H4Q3 707 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 EPDR1Q9UM22 224 aa7.24□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 SLC35B1P78383 322 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 HCP5Q6MZN7 132 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 DDB2Q92466 427 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 ATG101Q9BSB4 218 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TMEM178BH3BS89 294 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 GNG7O60262 68 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TSKUQ8WUA8 353 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 NRN1Q9NPD7 142 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 DPRXA6NFQ7 191 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 CEACAM4O75871 244 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 ZNF134P52741 427 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PSG9Q00887 426 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 C1RLQ9NZP8 487 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 OR5AL1P0C617 328 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PPIAL4GP0DN37 164 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 SELLP14151 372 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.23□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 EML6Q6ZMW3 1958 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TMEM11P17152 192 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 NHLRC2Q8NBF2 726 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 CACNA1DQ01668 2161 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 CCL3L1P16619 93 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 PRNTQ86SH4 94 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 LIPFP07098 398 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 MMDQ15546 238 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 Q6AWC8 147 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 SHANK1Q9Y566 2161 aa7.22□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 OR5AN1Q8NGI8 311 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 C8orf46Q8TAG6 207 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 RTTNQ86VV8 2226 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 IFITM10A6NMD0 228 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 GNB4Q9HAV0 340 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 HIF1ANQ9NWT6 349 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 V9GYV3 84 aa7.21□□□□□ -1.25
HERC3-201ENST00000264345 ICE1Q9Y2F5 2266 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TOX4O94842 621 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 MOSP00540 346 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 REG1AP05451 166 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 MFAP4P55083 255 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PLAUP00749 431 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 UCNP55089 124 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PVRIGQ6DKI7 326 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ZNF329Q86UD4 541 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 FAM122AQ96E09 287 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 Q9H3A6 140 aa7.21□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 INS-IGF2F8WCM5 200 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PRSS8Q16651 343 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 THAP8Q8NA92 274 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 NUDT11Q96G61 164 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 A0A1B0GWJ7 208 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 FOXC1Q12948 553 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 TMEM70Q9BUB7 260 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 LEPROTL1O95214 131 aa7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
HERC3-201ENST00000264345 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
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