RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FCGR3BO75015 233 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFA4P12838 97 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 EGR1P18146 543 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 LMO4P61968 165 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 Q0VG73 95 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB108BQ8NET1 73 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 PPP1R35Q8TAP8 253 aa21.33■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 ITGB1BP1O14713 200 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 GCHFRP30047 84 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 TEX43Q6ZNM6 134 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 GCSAMQ8N6F7 178 aa21.32■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 CRISP2P16562 243 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 TBX15Q96SF7 602 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB9BQ9NP90 201 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 FN1P02751 2386 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 HIVEP2P31629 2446 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 SCO2A0A1W2PP80 73 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV4-31P0DP07 118 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL29P47914 159 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 RELBQ01201 579 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 MORN2Q502X0 79 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 TEPPQ6URK8 271 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMD4Q96H15 378 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF7Q9UBF6 113 aa21.31■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 MIC13Q5XKP0 118 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 S1PR3Q99500 378 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP21.3■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 CUBNO60494 3623 aa21.3■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 RRHO14718 337 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 MT-ND6P03923 174 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 OR10J4P0C629 311 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM183BQ1AE95 376 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 RPEL1Q2QD12 228 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC29Q8WV35 223 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 GNB1LQ9BYB4 327 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 LPAR2Q9HBW0 351 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 LHBP01229 141 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV3-43DP0DP04 118 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 LGALS4P56470 323 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL31P62899 125 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 MIEN1Q9BRT3 115 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 GNG12Q9UBI6 72 aa21.29■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK11Q5JSL3 2073 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR73Q6P4I2 378 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4S2Q8NH73 311 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 SDSLQ96GA7 329 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 TCF19Q9Y242 345 aa21.28■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIAL4EA0A075B759 164 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 PGPEP1LA6NFU8 196 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIAL4DF5H284 164 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 F2RL2O00254 374 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 NUPR1O60356 82 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIAL4FP0DN26 164 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 IRF2P14316 349 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 PRDX2P32119 198 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB7AP51149 207 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 LYPD2Q6UXB3 125 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 RFESDQ8TAC1 157 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIAL4AQ9Y536 164 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R1X1 148 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 MGST3O14880 152 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 TFF1P04155 84 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 TCF23Q7RTU1 214 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5AU1Q8NGC0 362 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM167BQ9NRX6 74 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM140Q9NV12 185 aa21.27■■□□□ 1
CAPNS1-201ENST00000246533 PROP1O75360 226 aa21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP21.26■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 C15orf61A6NNL5 157 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 RTL8BQ17RB0 113 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 CD177Q8N6Q3 437 aa21.25■□□□□ 0.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 CFHR2P36980 270 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 TOMM20LQ6UXN7 152 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 STPG3Q8N7X2 389 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf24Q9BVV8 132 aa21.25■□□□□ 0.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 METRNQ9UJH8 293 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa21.25■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
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CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZWC4 215 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 DDB2Q92466 427 aa21.24■□□□□ 0.99
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC45A2Q9UMX9 530 aa21.24■□□□□ 0.99
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