RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 M0R2Z0 102 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 LYZL6O75951 148 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV2-8P01709 118 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CELA3BP08861 270 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3-43DP0DP04 118 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MGST1P10620 155 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CDKN1AP38936 164 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SPINK9Q5DT21 86 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZR03 302 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF826PQ6ZT77 177 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ASCL5Q7RTU5 278 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NIT1Q86X76 327 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf210Q8IVY1 113 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00311Q8N616 119 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 C5orf17Q8NAS9 161 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RFESDQ8TAC1 157 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF596Q8TC21 504 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf159Q96HA4 380 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 GPR82Q96P67 336 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 PAXXQ9BUH6 204 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 FREM1Q5H8C1 2179 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1B0GXF2 115 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB108AA8MXU0 73 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFRSF1AP19438 455 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 LGALS7P47929 136 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 PTTG1IPP53801 180 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MFAP2P55001 183 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 PLP1P60201 277 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MMDQ15546 238 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ALKBH6Q3KRA9 238 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 VMA21Q3ZAQ7 101 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC01559Q495D7 138 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 DOLPP1Q86YN1 238 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 LYG1Q8N1E2 194 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MUC15Q8N387 334 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4C13Q8NGP0 309 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TNFRSF14Q92956 283 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM186Q96B77 213 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TRGV9Q99603 122 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 HES7Q9BYE0 225 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 PLA2G3Q9NZ20 509 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CACNA1GO43497 2377 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SDK2Q58EX2 2172 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 PSMB11A5LHX3 300 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 VSTM5A8MXK1 200 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 K7EQM0 130 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 NPSP0C0P6 89 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 S100A7P31151 101 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CDKN1BP46527 198 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 FABP6P51161 128 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF137PP52743 207 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 BATFQ16520 125 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF329Q86UD4 541 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SPACA3Q8IXA5 215 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 GATD1Q8NB37 220 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.3□□□□□ -1.4
CAPNS1-202ENST00000586851 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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