RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 CCL8P80075 99 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PRR20EP86478 221 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PRR20CP86479 221 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PRR20DP86480 221 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PRR20BP86481 221 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PRR20AP86496 221 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 RPEL1Q2QD12 228 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 TOMM20LQ6UXN7 152 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 MMD2Q8IY49 270 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 FAM216BQ8N7L0 139 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 C11orf52Q96A22 123 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 TMEM106BQ9NUM4 274 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 SNURFLB1AK76 121 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 SPINK4O60575 86 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 CRYBB3P26998 211 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 LGALS4P56470 323 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 CENPWQ5EE01 88 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 Q6ZWC4 215 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 NEUROG1Q92886 237 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 TANC2Q9HCD6 1990 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 DSCAMO60469 2012 aa9.31□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 DYSFO75923 2080 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 SHISA9B4DS77 424 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 F2Z2F3 143 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 J3QR06 171 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 LINC00869P0C866 280 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 CA7P43166 264 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 GNG4P50150 75 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 KLRB1Q12918 225 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 BAGE3Q86Y29 109 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 BAGE2Q86Y30 109 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 NABP2Q9BQ15 211 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 SAP30LQ9HAJ7 183 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 V9GYV3 84 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 hADV38S2A0JD32 116 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 HELTA6NFD8 242 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 OR7C2O60412 319 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PAFAH1B2P68402 229 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 TDRG1Q3Y452 100 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PQLC2Q6ZP29 291 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 HSPB9Q9BQS6 159 aa9.3□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 DSCAML1Q8TD84 2053 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 MGAQ8IWI9 3026 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 TMEM178BH3BS89 294 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 IGKV1-16P04430 117 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 OR10J4P0C629 311 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 AREGP15514 252 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 CDKN1AP38936 164 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 SLC35B1P78383 322 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 ADTRPQ96IZ2 230 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 SLC45A2Q9UMX9 530 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 LY96Q9Y6Y9 160 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 E7EQL1 145 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 RANP62826 216 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 FXYD3Q14802 87 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 OR5AU1Q8NGC0 362 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 DYNLRB1Q9NP97 96 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PRNDQ9UKY0 176 aa9.29□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 ICE1Q9Y2F5 2266 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PLCE1Q9P212 2302 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PPIAL4EA0A075B759 164 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PPIAL4DF5H284 164 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 MMP23AO75900 390 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 CD3EP07766 207 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PPIAL4FP0DN26 164 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 TCL1AP56279 114 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PRCDQ00LT1 54 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 MLANAQ16655 118 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 ZNF503Q96F45 646 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 PPIAL4AQ9Y536 164 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 SPTBN2O15020 2390 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 GGTLC3B5MD39 225 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 ESDP10768 282 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 CHRNB4P30926 498 aa9.28□□□□□ -0.92
GGA3-205ENST00000578348 COTL1Q14019 142 aa9.28□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms