RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 DTD1Q8TEA8 209 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 RBKSQ9H477 322 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOTCH3Q9UM47 2321 aa25.51■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 MISP3Q96FF7 219 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCDC140Q96MF4 163 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 S4R3C0 116 aa25.5■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SNRPGP15A8MWD9 76 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRBV12-3P01733 135 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZP3P21754 424 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 PVRIGQ6DKI7 326 aa25.49■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 K7EIM0 57 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 MED6O75586 246 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-23P01764 117 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPNP16150 400 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC24A4Q8NFF2 622 aa25.48■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CORTO00230 105 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF502Q8TBZ5 544 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCARB1Q8WTV0 552 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR10C1Q96KK4 312 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLURP1P55000 103 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR4D5Q8NGN0 318 aa25.47■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf83Q53S99 150 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC19AQ6UXS0 136 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 C21orf62Q9NYP8 219 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 U3KQ87 197 aa25.46■■□□□ 1.67
CTDNEP1-209ENST00000574205 I3L2K1 104 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 CCSO14618 274 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ID3Q02535 119 aa25.45■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 CMYA5Q8N3K9 4069 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 BMPR1BO00238 502 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYNGR2O43760 224 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 MT-CO2P00403 227 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 C11orf87Q6NUJ2 197 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOXA1Q86UR1 476 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP6V0BQ99437 205 aa25.44■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC3BP05452 202 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPY1RP25929 384 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPEL1Q2QD12 228 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 DCUN1D4Q92564 292 aa25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP5D1E7EU14 171 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 IFNA10P01566 189 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAGT1Q9H0U3 335 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM25EA8MYX2 175 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR183P32249 361 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARL3P36405 182 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 RGS21Q2M5E4 152 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSKIPQ9P0R6 139 aa25.42■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 C5orf51A6NDU8 294 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 OVOL1O14753 267 aa25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 GGCTO75223 188 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 LY86O95711 162 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 IAPPP10997 89 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGLL1P15814 213 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM170AQ8WVE7 144 aa25.4■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 WRBO00258 174 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 OPRK1P41145 380 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 TATDN3Q17R31 274 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 GSG1LQ6UXU4 331 aa25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CTDNEP1-209ENST00000574205 F8W735 103 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 MFAP4P55083 255 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 Q56UQ5 140 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBAC2Q8NBM4 344 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 C2orf50Q96LR7 162 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 TXN2Q99757 166 aa25.38■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2T8A6NH00 312 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 SCGB1D2O95969 90 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 C7orf66A4D0T2 115 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 TGOLN2O43493 480 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 IGHV3-48P01763 117 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 OXLD1Q5BKU9 147 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPSB3Q6PJ21 355 aa25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 SYNJ2BPP57105 145 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPP30P78346 268 aaKnown RBP25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 SAMD5Q5TGI4 173 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 C1QL4Q86Z23 238 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR61Q9BZJ8 451 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa25.36■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 OR2C1O95371 312 aa25.35■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOTCH1P46531 2555 aa25.34■■□□□ 1.65
CTDNEP1-209ENST00000574205 G3V4G9 280 aa25.34■■□□□ 1.65
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