RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR9G1	Q8NH87	305 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM167A	Q8TBQ9	72 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	MS4A10	Q96PG2	267 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PPIAL4A	Q9Y536	164 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF292	O60281	2723 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CRISP2	P16562	243 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	LINC00311	Q8N616	119 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559		A0A0G2JNJ9	132 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	DPRX	A6NFQ7	191 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM178B	H3BS89	294 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559		K7EM74	188 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	KLK10	O43240	276 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SCGB1D1	O95968	90 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	MT-ND6	P03923	174 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ESD	P10768	282 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CHRNB4	P30926	498 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	RAB4B	P61018	213 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	WDR73	Q6P4I2	378 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF596	Q8TC21	504 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559		Q9UFV3	132 aa		14.95	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	GGTLC3	B5MD39	225 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	FCN1	O00602	326 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ISLR	O14498	428 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFB3	O43676	98 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CCL3L1	P16619	93 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TPPP2	P59282	170 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		14.94	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	PPOX	P50336	477 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	14.93	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	BSPH1	Q075Z2	132 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	OR5I1	Q13606	314 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	UNQ6494/PRO21346	Q6UXR6	183 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	OR1L4	Q8NGR5	311 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	MLANA	Q16655	118 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	NAGK	Q9UJ70	344 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		14.93	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	PSMB11	A5LHX3	300 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	IER3	P46695	156 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CX3CL1	P78423	397 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559		Q0VG73	95 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	OR8I2	Q8N0Y5	310 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SNURFL	B1AK76	121 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TAS2R60	P59551	318 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM106B	Q9NUM4	274 aa		14.92	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1B0GUS0	222 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	NUPR1	O60356	82 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	COX7A2P2	O60397	106 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	MC5R	P33032	325 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	REG1B	P48304	166 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF137P	P52743	207 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	BPIFB3	P59826	476 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CCL17	Q92583	94 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		14.91	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	COL8A2	P25067	703 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	CDC42EP3	Q9UKI2	254 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	THBD	P07204	575 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	SST	P61278	116 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	IBA57	Q5T440	356 aa	Known RBP	14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	C1orf194	Q5T5A4	169 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	BAGE3	Q86Y29	109 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	BAGE2	Q86Y30	109 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	NGB	Q9NPG2	151 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	JKAMP	Q9P055	326 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	MGA	Q8IWI9	3026 aa		14.9	□□□□□ -0.02
RRN3-205	ENST00000563559	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TDGF1P3	P51864	188 aa		14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	WT1-AS	Q06250	92 aa		14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	THAP8	Q8NA92	274 aa		14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		14.89	□□□□□ -0.03
RRN3-205	ENST00000563559	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		14.89	□□□□□ -0.03

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