RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		7	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		7	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617		A8MTW9	85 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF780A	O75290	641 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	HTN1	P15515	57 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	KCTD21	Q4G0X4	260 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MORN5	Q5VZ52	161 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MUL1	Q969V5	352 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	6.99	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617		U3KQE9	123 aa		6.99	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	RNF222	A6NCQ9	220 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MS4A2	Q01362	244 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	DHFR2	Q86XF0	187 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	C16orf74	Q96GX8	76 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	ADTRP	Q96IZ2	230 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SLC35E1	Q96K37	410 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00052	Q96N35	136 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	S100A13	Q99584	98 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SCPEP1	Q9HB40	452 aa		6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	SAMHD1	Q9Y3Z3	626 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	INS	P01308	110 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MFAP4	P55083	255 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	TDRG1	Q3Y452	100 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617		Q6ZTI0	123 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	NRN1	Q9NPD7	142 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617	BABAM2	Q9NXR7	383 aa		6.97	□□□□□ -1.29
ABCD4-222	ENST00000555617		A0A0J9YX75	114 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	AQP12B	A6NM10	295 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617		H7C1H1	209 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	OR2T7	P0C7T2	308 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	GYPE	P15421	78 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	HOXB6	P17509	224 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CEL	P19835	753 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CCDC124	Q96CT7	223 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	METTL26	Q96S19	204 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	QTRT1	Q9BXR0	403 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	POMP	Q9Y244	141 aa		6.96	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TRBV6-6	A0A0A6YYG2	114 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	PAX4	O43316	350 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	GNG7	O60262	68 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CRTAP	O75718	401 aa	Predicted RBP	6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ALPL	P05186	524 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	HTR1A	P08908	422 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TNFSF8	P32971	234 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	KCTD9	Q7L273	389 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617		Q8N3U1	123 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	IL22RA2	Q969J5	263 aa		6.95	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF98	A6NK75	572 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MT-CO2	P00403	227 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	RAP2A	P10114	183 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	UCP1	P25874	307 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF415	Q09FC8	603 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	FLOT2	Q14254	428 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	FFAR4	Q5NUL3	377 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	NEGR1	Q7Z3B1	354 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	OR11H7	Q8NGC8	314 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	MOB3A	Q96BX8	217 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	C20orf173	Q96LM9	149 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC01587	Q99440	93 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	AK3	Q9UIJ7	227 aa		6.94	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	SOCS3	O14543	225 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	PRAF2	O60831	178 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV2-14	P01704	120 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-30	P01768	117 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-33	P01772	117 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	OSM	P13725	252 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	HTR2C	P28335	458 aa		6.93	□□□□□ -1.3
ABCD4-222	ENST00000555617	TAS2R60	P59551	318 aa		6.93	□□□□□ -1.3

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