RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535535.5

LMO3-212, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-212ENST00000535535 PLPP1O14494 284 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 OR2H2O95918 312 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 CGAP01215 116 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ZNF708P17019 499 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 CFHR3Q02985 330 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 FMODQ06828 376 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 C1orf195Q5TG92 126 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 OLFML2AQ68BL7 652 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 KCNRGQ8N5I3 272 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 DEFB125Q8N687 156 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 GATD1Q8NB37 220 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TIMD4Q96H15 378 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 PRNDQ9UKY0 176 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.34□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 A0A096LNT2 108 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 G3V2L1 256 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 MPDU1O75352 247 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 IGHV4-39P01824 125 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 DANCRP0C864 163 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 NTF3P20783 257 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 PTGDSP41222 190 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TGFBR3Q03167 851 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 Q6ZN92 141 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 IQCF1Q8N6M8 205 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ATP5SQ99766 215 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ACER3Q9NUN7 267 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 OARD1Q9Y530 152 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa6.33□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 DAPL1A0PJW8 107 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 MSGN1A6NI15 193 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 NME4O00746 187 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 AGPAT2O15120 278 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 IL5P05113 134 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 SPINK8P0C7L1 97 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 SSR2P43308 183 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 GZMMP51124 257 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 FOXA1P55317 472 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TAS2R19P59542 299 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 GNG5P63218 68 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 PSG9Q00887 426 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 CD164Q04900 197 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 PSG7Q13046 419 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 GUSBP1Q15486 140 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 C4orf26Q17RF5 130 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ALG10Q5BKT4 473 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 GLYATL3Q5SZD4 288 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 PRR22Q8IZ63 422 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 SLC25A40Q8TBP6 338 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TMEM101Q96IK0 257 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 CHIAQ9BZP6 476 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 EHFQ9NZC4 300 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 FUT9Q9Y231 359 aa6.32□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 CD300LBA8K4G0 201 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TAX1BP3O14907 124 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 DIRAS1O95057 198 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 SCTP09683 121 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 LINC00032P0C843 101 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 ZNF728P0DKX0 622 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TPT1P13693 172 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 RPL3P39023 403 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 LEPP41159 167 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 TDRG1Q3Y452 100 aa6.31□□□□□ -1.4
LMO3-212ENST00000535535 MIDNQ504T8 468 aa6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57 ms