RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 GCSAMQ8N6F7 178 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10V1Q8NGI7 309 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10X1Q8NGY0 326 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GALMQ96C23 342 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR82Q96P67 336 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SAP30LQ9HAJ7 183 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 DECR2Q9NUI1 292 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa5.97□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV24A0A0B4J272 114 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1B0GUS0 222 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 PITX3O75364 302 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 KBTBD11O94819 623 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 FSTL3O95633 263 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 NAPSAO96009 420 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GPX1P07203 203 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ADMP35318 185 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 RBMXP38159 391 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ID1P41134 155 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 SNU13P55769 128 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL23P62829 140 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf71Q6IPW1 123 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 MOB1BQ7L9L4 216 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 GAPTQ8N292 157 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.96□□□□□ -1.45
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 WNT9BO14905 357 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 S1PR2O95136 353 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CNIH1O95406 144 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CRISP2P16562 243 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 EGR1P18146 543 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 AMY2BP19961 511 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 GNG4P50150 75 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF585BQ52M93 769 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SPRNQ5BIV9 151 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52E5Q8NH55 327 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP1R35Q8TAP8 253 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SMIM7Q9BQ49 75 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 VCX2Q9H322 139 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF286AQ9HBT8 521 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ERG28Q9UKR5 140 aa5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 PSG2P11465 335 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 F2RP25116 425 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 RHOBP62745 196 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL32P62910 135 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL8P80075 99 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MPV17L2Q567V2 206 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 C5orf47Q569G3 176 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35E4Q6ICL7 350 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 FA2HQ7L5A8 372 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 BAGE3Q86Y29 109 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 BAGE2Q86Y30 109 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5H2Q8NGV7 314 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 BLNKQ8WV28 456 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 NINJ1Q92982 152 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ST20Q9HBF5 79 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 NRN1Q9NPD7 142 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 GNG13Q9P2W3 67 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 WASHC3Q9Y3C0 194 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 OOEPA6NGQ2 149 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM178BH3BS89 294 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 WIPF1O43516 503 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 VENTXO95231 258 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 HBZP02008 142 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 PRDX2P32119 198 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR2DS4P43632 304 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXL1Q12952 345 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 KIR2DS1Q14954 304 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 PDCD1Q15116 288 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF497Q6ZNH5 498 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXI2Q6ZQN5 318 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 RDH5Q92781 318 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 AP1S3Q96PC3 154 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM234AQ9H0X4 552 aa5.95□□□□□ -1.46
SMARCE1-211ENST00000493660 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms