RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480171.7

PKP4-210, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 2,772 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-210ENST00000480171 PQLC2Q6ZP29 291 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 LYG1Q8N1E2 194 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 LEAP2Q969E1 77 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 NABP2Q9BQ15 211 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.14□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TECTAO75443 2155 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 OR10J4P0C629 311 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 LINC00869P0C866 280 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 CGB3P0DN86 165 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 CGB7P0DN87 165 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 POU2AF1Q16633 256 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 C17orf58Q2M2W7 97 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 CENPWQ5EE01 88 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 PLA2G2CQ5R387 149 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 V9GYV3 84 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 URB1O60287 2271 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TNFSF13O75888 250 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 CRYBB3P26998 211 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ZNF83P51522 516 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 PRCDQ00LT1 54 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TMEM30BQ3MIR4 351 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 Q6ZWC4 215 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 OR8I2Q8N0Y5 310 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 OSTCQ9NRP0 149 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 SLC25A15Q9Y619 301 aa7.13□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 SPRY3O43610 288 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 OR7C2O60412 319 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 LRP11Q86VZ4 500 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 FDCSPQ8NFU4 85 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 STARD4Q96DR4 205 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 VAMP8Q9BV40 100 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 M0R1B8 84 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 UPK2O00526 184 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 LHBP01229 141 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 BRS3P32247 399 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 GLRXP35754 106 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TDGF1P3P51864 188 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 SCGB2A2Q13296 93 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 OR5I1Q13606 314 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 PNKDQ8N490 385 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 GCM1Q9NP62 436 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 RNF7Q9UBF6 113 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 NKX2-8O15522 239 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 OR5G3P0C626 314 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 CX3CL1P78423 397 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 RNF2Q99496 336 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ATG101Q9BSB4 218 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 CUL9Q8IWT3 2517 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ISLRO14498 428 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 C2orf83Q53S99 150 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 IGFL2Q6UWQ7 119 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 VN1R17PQ8TDU5 208 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 A0A1W2PRE2 83 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TM4SF5O14894 197 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 KLK10O43240 276 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 C8orf88P0DMB2 117 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 MYOD1P15172 320 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 LINC00310P59036 64 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 MSMPQ1L6U9 139 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TIMM23BQ5SRD1 257 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 DOLPP1Q86YN1 238 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 OR5B3Q8NH48 314 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 FAM222BQ8WU58 562 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.1□□□□□ -1.27
PKP4-210ENST00000480171 A0A1W2PRX2 142 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms