RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473778.5

C9orf3-214, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf3, Length 2,396 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-214ENST00000473778 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 LRFN3Q9BTN0 628 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 J3QR06 171 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 K7EP13 123 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 GATA4P43694 442 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 POU2AF1Q16633 256 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 RNF151Q2KHN1 245 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 TDRG1Q3Y452 100 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 SMIM15Q7Z3B0 74 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 TXNDC17Q9BRA2 123 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 SLC45A2Q9UMX9 530 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 V9GYV3 84 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.92□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 A0A1W2PN81 502 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 CCL25O15444 150 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 RANP62826 216 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 PSG5Q15238 335 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 OR9G1Q8NH87 305 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 NABP2Q9BQ15 211 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 IL36BQ9NZH7 164 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 GGTLC3B5MD39 225 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 CEACAM4O75871 244 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 OR10J4P0C629 311 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 CRYBB3P26998 211 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 LGALS4P56470 323 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 PRCDQ00LT1 54 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF90Q03938 601 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF788Q6ZQV5 615 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 Q6ZWC4 215 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 SLC35E1Q96K37 410 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 MS4A10Q96PG2 267 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 RNF7Q9UBF6 113 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 RNF114Q9Y508 228 aa8.91□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 C9JCJ5 164 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 UPK2O00526 184 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 CENPWQ5EE01 88 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.9□□□□□ -0.98
C9orf3-214ENST00000473778 SPINK4O60575 86 aa8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 SERF1AO75920 110 aa8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 AREGP15514 252 aa8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 TOMM20LQ6UXN7 152 aa8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 MMD2Q8IY49 270 aa8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 PRSS47A8MTI9 375 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 IGLV2-8P01709 118 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 CDKN1AP38936 164 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 IER3P46695 156 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 SLC35B1P78383 322 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 CCL8P80075 99 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 FXYD3Q14802 87 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 OR1L6Q8NGR2 347 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 ENY2Q9NPA8 101 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 IL19Q9UHD0 177 aa8.89□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 TRAV5A0A0B4J249 113 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 PSMB11A5LHX3 300 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 CBY3A6NI87 242 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 CCL3L1P16619 93 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 REG1BP48304 166 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 LRBAP50851 2863 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 IGHV3-48P01763 117 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 TEX43Q6ZNM6 134 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 LINC00479Q96M42 142 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 PRNDQ9UKY0 176 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.88□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 HELTA6NFD8 242 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 CGB1A6NKQ9 187 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 SNURFLB1AK76 121 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 OR7C2O60412 319 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 CIDEAO60543 219 aa8.87□□□□□ -0.99
C9orf3-214ENST00000473778 NDUFB8O95169 186 aa8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms