RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP-1.28□□□□□ -2.61
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SHQ1-204ENST00000468347 CFL2Q9Y281 166 aa-1.28□□□□□ -2.61
SHQ1-204ENST00000468347 V9GYY5 206 aaPredicted RBP-1.28□□□□□ -2.61
SHQ1-204ENST00000468347 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-1.28□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RREB1Q92766 1687 aa-1.29□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TOPBP1Q92547 1522 aa-1.29□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP-1.29□□□□□ -2.622e-8■■■■■ 31.6
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SHQ1-204ENST00000468347 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa-1.29□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 ZNF815PA8K554 130 aa-1.29□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 H7C2Y5 167 aa-1.29□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 M0QYV0 167 aa-1.29□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PMCHP20382 165 aa-1.29□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DEKP35659 375 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RPS5P46782 204 aaKnown RBP-1.29□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 RHEBQ15382 184 aa-1.29□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-1.29□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 OR52E4Q8NGH9 312 aa-1.29□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR51Q1Q8NH59 317 aa-1.29□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 MED10Q9BTT4 135 aa-1.29□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa-1.29□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 IL36BQ9NZH7 164 aa-1.29□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 DOCK1Q14185 1865 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 MYO3BQ8WXR4 1341 aa-1.3□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 TEN1Q86WV5 123 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SPICQ8N5J4 248 aa-1.3□□□□□ -2.62
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SHQ1-204ENST00000468347 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 GINS4Q9BRT9 223 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PRRG3Q9BZD7 231 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CLSTN2Q9H4D0 955 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ELOVL6Q9H5J4 265 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 POLE3Q9NRF9 147 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM216Q9P0N5 145 aa-1.3□□□□□ -2.62
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