RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF664Q8N3J9 261 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF503Q96F45 646 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF292O60281 2723 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 PDPNQ86YL7 162 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 OR2T6Q8NHC8 308 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM186Q96B77 213 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 ABHD17AQ96GS6 310 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A33Q9BSK2 321 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM106BQ9NUM4 274 aa14.87□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1B0GUS0 222 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 GRIFINA4D1Z8 144 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 OR4A5Q8NH83 315 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 GGTLC3B5MD39 225 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 THBDP07204 575 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 LGALS4P56470 323 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 GFRALQ6UXV0 394 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 OR1L6Q8NGR2 347 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 V9GYV3 84 aa14.86□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PRE2 83 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 FCN1O00602 326 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 FCN3O75636 299 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 SCGB1D1O95968 90 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 TDGF1P3P51864 188 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 FAM71F2Q6NXP2 309 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 ASCL5Q7RTU5 278 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 CMTM2Q8TAZ6 248 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 RNF2Q99496 336 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 AKAP13Q12802 2813 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 CUL9Q8IWT3 2517 aa14.85□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 E7EUB6 86 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 INS-IGF2F8WCM5 200 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 LYPD2Q6UXB3 125 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 SSX8Q7RTT4 187 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 OR8I2Q8N0Y5 310 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 WASHC3Q9Y3C0 194 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 ROS1P08922 2347 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 A8MWP6 167 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 PAX1P15863 534 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 CRISP2P16562 243 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 IER3P46695 156 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 SELENOTP62341 195 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 DYNLRB1Q9NP97 96 aa14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 SNURFLB1AK76 121 aa14.83□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 COX7A2P2O60397 106 aa14.83□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.83□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 MS4A10Q96PG2 267 aa14.83□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
SYNE4-204ENST00000465425 NUPR1O60356 82 aa14.83□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 WT1-ASQ06250 92 aa14.83□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 TCF15Q12870 199 aa14.83□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 C10orf55Q5SWW7 151 aa14.83□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 LINC00311Q8N616 119 aa14.83□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 MGST1P10620 155 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 ATMQ13315 3056 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 BPIFB3P59826 476 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 OR1L4Q8NGR5 311 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 NPIPB3Q92617 1050 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A2Q9BXI2 301 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 NGBQ9NPG2 151 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 OSTCQ9NRP0 149 aa14.82□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 TRAV5A0A0B4J249 113 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A17O43808 307 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 PPOXP50336 477 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 FXYD3Q14802 87 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 MORN5Q5VZ52 161 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF596Q8TC21 504 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 JKAMPQ9P055 326 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 CTSZQ9UBR2 303 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 ZGRF1Q86YA3 2104 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 BSNQ9UPA5 3926 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 PSMB11A5LHX3 300 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 TPPP2P59282 170 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.81□□□□□ -0.04
SYNE4-204ENST00000465425 GNB1LQ9BYB4 327 aa14.81□□□□□ -0.04
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