RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.94□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.94□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.94□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 WASHC3Q9Y3C0 194 aa6.94□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.94□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 MGAQ8IWI9 3026 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 HCFC1P51610 2035 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 A0A0G2JNJ9 132 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 DPRXA6NFQ7 191 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 LINC00587B1AMM8 73 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 H0YJW9 148 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 ISLRO14498 428 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 GNG4P50150 75 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 UBE2G2P60604 165 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 RANP62826 216 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 ZNF90Q03938 601 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 GAMTQ14353 236 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 IQCJQ1A5X6 159 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 RPEL1Q2QD12 228 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 TMEM200BQ69YZ2 307 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 ALKBH2Q6NS38 261 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 TCF23Q7RTU1 214 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 OCC1Q8TAD7 63 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 RND1Q92730 232 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 HARBI1Q96MB7 349 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 HINT2Q9BX68 163 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 Q9UFV3 132 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 ITPR1Q14643 2758 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 COL6A6A6NMZ7 2263 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.93□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 ESDP10768 282 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 IGFBP2P18065 325 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 OR10J1P30954 320 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 GNG10P50151 68 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 CCL8P80075 99 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 PSG5Q15238 335 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 C4orf17Q53FE4 359 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SPRNQ5BIV9 151 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 CYB5R2Q6BCY4 276 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 S100A7AQ86SG5 101 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 WFDC8Q8IUA0 241 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 MMD2Q8IY49 270 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 THAP8Q8NA92 274 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 ZNF114Q8NC26 417 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 NECAP1Q8NC96 275 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SSMEM1Q8WWF3 244 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 PLPPR2Q96GM1 343 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 C1orf159Q96HA4 380 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 RNF24Q9Y225 148 aa6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SPTA1P02549 2419 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 ZZEF1O43149 2961 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 DOCK11Q5JSL3 2073 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 AMBPP02760 352 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 GNLYP22749 145 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 PPOXP50336 477 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 BSPH1Q075Z2 132 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 Q0VG73 95 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 TMEM155Q4W5P6 130 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 FAM201AQ5SY85 155 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 LEAP2Q969E1 77 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 DYSFO75923 2080 aa6.91□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.9□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.9□□□□□ -1.3
ACTB-208ENST00000464611 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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