RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-202ENST00000444040 ERVFC1-1P60608 527 aa12.91□□□□□ -0.34
SHQ1-202ENST00000444040 TMEM256Q8N2U0 113 aa12.91□□□□□ -0.34
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SHQ1-202ENST00000444040 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa12.9□□□□□ -0.34
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SHQ1-202ENST00000444040 TSTD3H0UI37 97 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 RPEL1Q2QD12 228 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 VMA21Q3ZAQ7 101 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 THAP8Q8NA92 274 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 C14orf144Q96I85 54 aa12.89□□□□□ -0.35
SHQ1-202ENST00000444040 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa12.89□□□□□ -0.35
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