RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 STAG3L3P0CL85 134 aa15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 ERHP84090 104 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 C1orf174Q8IYL3 243 aa15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 FAM169BQ8N8A8 192 aa15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 RAB9BQ9NP90 201 aa15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 LINC00312Q9Y6C7 94 aa15.97■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 GATA4P43694 442 aa15.96■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 HILPDAQ9Y5L2 63 aa15.96■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 HIST1H2BLQ99880 126 aa15.96■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 CTDSP1Q9GZU7 261 aa15.96■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa15.96■□□□□ 0.15
TTLL3-210ENST00000427220 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.142e-7■■■■□ 24.5
TTLL3-210ENST00000427220 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa15.96■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 LINC00869P0C866 280 aa15.96■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 VWC2Q2TAL6 325 aa15.96■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 FAM209BQ5JX69 171 aa15.96■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 SFRP2Q96HF1 295 aa15.96■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 SLC35E1Q96K37 410 aa15.96■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 H0YJW9 148 aa15.95■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 TDGF1P3P51864 188 aa15.95■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 RND2P52198 227 aa15.95■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 OR10G8Q8NGN5 311 aa15.95■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 ADTRPQ96IZ2 230 aa15.95■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 PDE6DO43924 150 aa15.95■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 CDSNQ15517 529 aa15.95■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 ASCL2Q99929 193 aa15.95■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 CD3EP07766 207 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 IER3P46695 156 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 RANP62826 216 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 TMEM256Q8N2U0 113 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 OR1B1Q8NGR6 318 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 FAM222BQ8WU58 562 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 SRD5A3Q9H8P0 318 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 PRCDQ00LT1 54 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 WT1-ASQ06250 92 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 PRSS46E5RG02 174 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 ARF6P62330 175 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 OR5AU1Q8NGC0 362 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 OR51M1Q9H341 326 aa15.94■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.93■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 COX7A2P2O60397 106 aa15.93■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 MT-CO2P00403 227 aa15.93■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 OR8I2Q8N0Y5 310 aa15.93■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 OR1L8Q8NGR8 309 aa15.93■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 KCNIP2Q9NS61 270 aa15.93■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 MPDU1O75352 247 aa15.93■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 AREGP15514 252 aa15.93■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 CENPWQ5EE01 88 aa15.93■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa15.93■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 RBPJQ06330 500 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 OR1P1Q8NH06 330 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 OR52E5Q8NH55 327 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 HELTA6NFD8 242 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 LOXP28300 417 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 GNG4P50150 75 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 GNG5P63218 68 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 HES1Q14469 280 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 FBXL15Q9H469 300 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 SCGB1D1O95968 90 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 MUC15Q8N387 334 aa15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 K7EN84 100 aa15.91■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 NUBP1P53384 320 aa15.91■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 SHISA9B4DS77 424 aa15.91■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 CR1LQ2VPA4 569 aa15.91■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 NGBQ9NPG2 151 aa15.91■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 SSUH2Q9Y2M2 353 aa15.91■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 INSIG2Q9Y5U4 225 aa15.91■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 CENPEQ02224 2701 aa15.91■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 AMBPP02760 352 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 ANAPC16Q96DE5 110 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 CNIH1O95406 144 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 MAS1LP35410 378 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 PNKDQ8N490 385 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 NUP37Q8NFH4 326 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 OR4C13Q8NGP0 309 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 PITPNC1Q9UKF7 332 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 DSCAML1Q8TD84 2053 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 NUPR1O60356 82 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 SLC45A2Q9UMX9 530 aa15.9■□□□□ 0.14
TTLL3-210ENST00000427220 CASP6P55212 293 aa15.89■□□□□ 0.13
TTLL3-210ENST00000427220 TEX36Q5VZQ5 186 aa15.89■□□□□ 0.13
TTLL3-210ENST00000427220 SLC25A33Q9BSK2 321 aa15.89■□□□□ 0.13
TTLL3-210ENST00000427220 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa15.89■□□□□ 0.13
TTLL3-210ENST00000427220 FCN1O00602 326 aa15.89■□□□□ 0.13
TTLL3-210ENST00000427220 KLRD1Q13241 179 aa15.89■□□□□ 0.13
TTLL3-210ENST00000427220 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms