RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 HES7Q9BYE0 225 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 LILRA1O75019 489 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TEX45Q8NA69 505 aa8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 FREM3P0C091 2139 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 FAM231BA6NCW3 169 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 PFN1P07737 140 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 PSG3Q16557 428 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 RNFT1Q5M7Z0 435 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 Q6AWC8 147 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 CFHR5Q9BXR6 569 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 M0R381 172 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 C19orf54Q5BKX5 351 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 ASCL5Q7RTU5 278 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 TMEM144Q7Z5S9 345 aa8.21□□□□□ -1.09
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PQM1 296 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 IGLC2P0DOY2 106 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 IGLC3P0DOY3 106 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 GFRALQ6UXV0 394 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 RNF144BQ7Z419 303 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 NUP37Q8NFH4 326 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 MRAP2Q96G30 205 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PS18 150 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.21□□□□□ -1.1
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HERC3-202ENST00000402738 MFAP4P55083 255 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZWC4 215 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 EPDR1Q9UM22 224 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 ESPL1Q14674 2120 aa8.21□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 JMJD8Q96S16 334 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 CCL1P22362 96 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 NMSQ5H8A3 153 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 STPG4Q8N801 248 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 CITED1Q99966 193 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 QSER1Q2KHR3 1735 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 FXYD7P58549 80 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 RAB1CQ92928 201 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 METTL26Q96S19 204 aa8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 ZNF138P52744 262 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 TREML4Q6UXN2 200 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 S4R3C0 116 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 ZNF815PA8K554 130 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 C9JCJ5 164 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 LHX2P50458 406 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 ZNF56Q15929 161 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 SYT8Q8NBV8 401 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
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HERC3-202ENST00000402738 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa8.19□□□□□ -1.1
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HERC3-202ENST00000402738 KIR3DL3Q8N743 410 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 GGTLC1Q9BX51 225 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 MYOFQ9NZM1 2061 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 IGKV1D-12P01611 117 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.19□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 PPP1R17O96001 155 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 OR9G9P0C7N8 305 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 EVI2AP22794 236 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 ID1P41134 155 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZVH6 145 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 FGF11Q92914 225 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 FOXH1O75593 365 aa8.18□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
HERC3-202ENST00000402738 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
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