RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 MEOX2P50222 304 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 BPIFB3P59826 476 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 WT1-ASQ06250 92 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TNXAQ16473 311 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PNKDQ8N490 385 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.67□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1W2PPI3 338 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF98A6NK75 572 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PPP5D1E7EU14 171 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TRGC2P03986 189 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 OR5G3P0C626 314 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C1QTNF9P0C862 333 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SMIM6P0DI80 62 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 CD99P14209 185 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 NPPCP23582 126 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SRP14P37108 136 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PSG5Q15238 335 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PRSS8Q16651 343 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 LINC01551Q86U37 167 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 OR1L4Q8NGR5 311 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PFDN5Q99471 154 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 E7EUB6 86 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 CORTO00230 105 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 COX7A2P2O60397 106 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PLGLAQ15195 96 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 BTF3L4Q96K17 158 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 DERL1Q9BUN8 251 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 CHODLQ9H9P2 273 aa6.66□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ABCA4P78363 2273 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1W2PPQ1 181 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 CGB1A6NKQ9 187 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C8orf88P0DMB2 117 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 DLX1P56177 255 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 NDUFA6P56556 154 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SELENOTP62341 195 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 LY6DQ14210 128 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF114Q8NC26 417 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C11orf52Q96A22 123 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.65□□□□□ -1.34
VAMP3-201ENST00000054666 C22orf46C9J442 243 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 M0R1W7 72 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2BKO60814 126 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 FOXH1O75593 365 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 LY6HO94772 140 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 REG1AP05451 166 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2BJP06899 126 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 SOD3P08294 240 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 AREGP15514 252 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2BOP23527 126 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2BBP33778 126 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 CEACAM3P40198 252 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 COMPP49747 757 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2BDP58876 126 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2BCP62807 126 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 MLANAQ16655 118 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 PPP1R27Q86WC6 154 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 NPIPB3Q92617 1050 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 MISP3Q96FF7 219 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 RNF5Q99942 180 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.65□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 C9JCJ5 164 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 HTR1DP28221 377 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 DTX2Q86UW9 622 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 THAP8Q8NA92 274 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 LY6G5BQ8NDX9 201 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 OR2T10Q8NGZ9 312 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 SFRP2Q96HF1 295 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 RITA1Q96K30 269 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 PRORYQ9H606 182 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa6.64□□□□□ -1.35
VAMP3-201ENST00000054666 NBASA2RRP1 2371 aa6.64□□□□□ -1.35
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