RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	ACTL6B	O94805	426 aa		15.02	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	RPL19	P84098	196 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	15.02	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		15.02	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	15.02	■□□□□ -0
RRN3-205	ENST00000563559	OR4A8	P0C604	315 aa		15.02	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	15.02	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	YLPM1	P49750	1951 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	HELT	A6NFD8	242 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF705G	A8MUZ8	300 aa	Predicted RBP	15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559		K7EN84	100 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	HNF1A	P20823	631 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PRSS8	Q16651	343 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	COMMD5	Q9GZQ3	224 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR5G3	P0C626	314 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	RNASE2	P10153	161 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	GNG4	P50150	75 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ERH	P84090	104 aa	Known RBP	15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CD69	Q07108	199 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SSX8	Q7RTT4	187 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF714	Q96N38	554 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	RNF2	Q99496	336 aa		15.01	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		15	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	C17orf100	A8MU93	164 aa		15	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf97	H3BN30	126 aa		15	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR10J1	P30954	320 aa		15	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SELENOT	P62341	195 aa		15	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CCL8	P80075	99 aa		15	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	RPEL1	Q2QD12	228 aa		15	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	15	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	HARBI1	Q96MB7	349 aa		15	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		15	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TRBV9	A0A0B4J1U6	114 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559		A8MWP6	167 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR10J4	P0C629	311 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ERVFC1-1	P60608	527 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM177	Q53S58	311 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR5AN1	Q8NGI8	311 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR4A5	Q8NH83	315 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFA4L2	Q9NRX3	87 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	DLL1	O00548	723 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR7C2	O60412	319 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	USF1	P22415	310 aa	Predicted RBP	14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ADM	P35318	185 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	RND1	Q92730	232 aa		14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	14.99	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CEP250	Q9BV73	2442 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PN81	502 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559		A0A1W2PRE2	83 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559		H0YJW9	148 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	LGALS4	P56470	323 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CENPW	Q5EE01	88 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	DCAF16	Q9NXF7	216 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf88	P0DMB2	117 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ADIPOQ	Q15848	244 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TIGIT	Q495A1	244 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	MMD2	Q8IY49	270 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		14.98	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SLC17A3	O00476	420 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PRRG2	O14669	202 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CRYBB3	P26998	211 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	MOB3B	Q86TA1	216 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	FAM122A	Q96E09	287 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		14.97	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	VSTM5	A8MXK1	200 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PAFAH1B2	P68402	229 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	COX19	Q49B96	90 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PDPN	Q86YL7	162 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM186	Q96B77	213 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF503	Q96F45	646 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	MRPL18	Q9H0U6	180 aa	Known RBP	14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	OSTC	Q9NRP0	149 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559		V9GYV3	84 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PPIAL4D	F5H284	164 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	CBLN1	P23435	193 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	SUB1	P53999	127 aa	Known RBP eCLIP	14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		14.96	□□□□□ -0.01
RRN3-205	ENST00000563559	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		14.96	□□□□□ -0.01

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