RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 IGKV1D-39P04432 117 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 SPCS2Q15005 226 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 TMEM229BQ8NBD8 167 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 TERB2Q8NHR7 220 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 MARC2Q969Z3 335 aa8.67□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 DBX1A6NMT0 343 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 CTDSP2O14595 271 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 CTDSPLO15194 276 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 B3GALNT1O75752 331 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 IGHV3-23P01764 117 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 MFAP2P55001 183 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 TAS2R19P59542 299 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 ZNF114Q8NC26 417 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 OR1P1Q8NH06 330 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 SMIM4Q8WVI0 70 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 HIPK2Q9H2X6 1198 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 NSG2Q9Y328 171 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 S4R3C0 116 aa8.66□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 TRAV25A0A0B4J276 109 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 INS-IGF2F8WCM5 200 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 K7EIM0 57 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 TGOLN2O43493 480 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 P0C879 139 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 RPL5P46777 297 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 PIGPP57054 158 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 PRCDQ00LT1 54 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 SLC25A24Q6NUK1 477 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 PLET1Q6UQ28 207 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 OR2C3Q8N628 320 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 OR4D10Q8NGI6 311 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 SCARB1Q8WTV0 552 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 TUBA4BQ9H853 241 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
CS-221ENST00000550734 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 ZNF320A2RRD8 509 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 F8W735 103 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 NDUFA4O00483 81 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 RGS5O15539 181 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 ATG12O94817 140 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 RAB3DO95716 219 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 EDN2P20800 178 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 GPR183P32249 361 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 CD81P60033 236 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 MEF2DQ14814 521 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 STEAP1BQ6NZ63 245 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 OR4A16Q8NH70 328 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 MRGPRFQ96AM1 343 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 TP53RKQ96S44 253 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 TXN2Q99757 166 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 NEURL2Q9BR09 285 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 HINT2Q9BX68 163 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 MLXQ9UH92 298 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 UFC1Q9Y3C8 167 aa8.64□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 I3L2K1 104 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 K7EMT4 169 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 IGKV1-5P01602 117 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 CTSGP08311 255 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 PGAM2P15259 253 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 PI3P19957 117 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 UCP1P25874 307 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 AARDQ4LEZ3 155 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 TM4SF20Q53R12 229 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 PVRIGQ6DKI7 326 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 OR13C8Q8NGS7 320 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 DIRAS2Q96HU8 199 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 SOSTQ9BQB4 213 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 C5orf66Q9H5L9 145 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 RETNQ9HD89 108 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 CEPT1Q9Y6K0 416 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.63□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 A0A0B4J293 547 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 OR2T8A6NH00 312 aa8.62□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
CS-221ENST00000550734 CDS2O95674 445 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.6 ms