RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 MCUBQ9NWR8 336 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 COMMD9Q9P000 198 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 COPZ2Q9P299 210 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 V9GYH0 126 aa7.42□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 H3BUA1 57 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SNAPC5O75971 98 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SERPINE2P07093 398 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 AREGP15514 252 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SLURP1P55000 103 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 OR2B8PP59922 312 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 RND3P61587 244 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 RUNX1Q01196 453 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 ZNF45Q02386 682 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 RAB32Q13637 225 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 OR10W1Q8NGF6 305 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 DCUN1D4Q92564 292 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TP53RKQ96S44 253 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 HINT2Q9BX68 163 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 COMMD5Q9GZQ3 224 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TNCP24821 2201 aa7.41□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 A0A0G2JLM5 398 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 LINC01619G3V211 115 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 OR2J3O76001 311 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 OR8U8P0C7N1 319 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 PSMB6P28072 239 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 RHOGP84095 191 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 ATP5G2Q06055 141 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 FHL3Q13643 280 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SPANXN2Q5MJ10 180 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SLC25A42Q86VD7 318 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SEC22AQ96IW7 307 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 PRRT1Q99946 306 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 C5orf66Q9H5L9 145 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 GPR132Q9UNW8 380 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 OR51B2Q9Y5P1 312 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 S4R3C0 116 aa7.4□□□□□ -1.22
CS-217ENST00000550044 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 NPIPB5A8MRT5 1133 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 H0Y980 276 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 NDUFB8O95169 186 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 BRI3O95415 125 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 TRBV12-3P01733 135 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 IGHV3-23P01764 117 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 OR5AC1P0C628 307 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 DEFA4P12838 97 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 CTRB1P17538 263 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 ETV6P41212 452 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 LINC00310P59036 64 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 TRIM16LQ309B1 348 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 CTRB2Q6GPI1 263 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 OR1L8Q8NGR8 309 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 OR4A16Q8NH70 328 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 USMG5Q96IX5 58 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 ASCL2Q99929 193 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 SRRQ9GZT4 340 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 PALMDQ9NP74 551 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 HERC2O95714 4834 aa7.39□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 IGLC7A0M8Q6 106 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 OVOL1O14753 267 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 LY86O95711 162 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 IGKV1-5P01602 117 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 CRYGCP07315 174 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 OR13C7P0DN81 318 aa7.38□□□□□ -1.23
CS-217ENST00000550044 FAUP35544 74 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
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