RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 AREGP15514 252 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 M6PRP20645 277 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PRSS8Q16651 343 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 GUK1Q16774 197 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ACY3Q96HD9 319 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TBX15Q96SF7 602 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SIRPDQ9H106 197 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 GNG13Q9P2W3 67 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ABCA2Q9BZC7 2435 aa6.76□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 CGB1A6NKQ9 187 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SAA4P35542 130 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 OPRK1P41145 380 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PAX2Q02962 417 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ZNF726P1Q15940 193 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 MIC13Q5XKP0 118 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SLC39A9Q9NUM3 307 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SFTA3P0C7M3 94 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ADCYAP1P18509 176 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SERF2P84101 59 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 OR10G4Q8NGN3 311 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 OR10G9Q8NGN4 311 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 OR10G7Q8NGN6 311 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 OR2T6Q8NHC8 308 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ABHD5Q8WTS1 349 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ODF3BA8MYP8 253 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SOX15O60248 233 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 FBP1P09467 338 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 GUCA2BQ16661 112 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ATRAIDQ6UW56 229 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 MMD2Q8IY49 270 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TEX45Q8NA69 505 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 MISP3Q96FF7 219 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 MGST2Q99735 147 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 KIAA1456Q9P272 454 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TRAV40A0A0B4J280 105 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PRSS46E5RG02 174 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 LY86O95711 162 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 MOSP00540 346 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 BTN1A1Q13410 526 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 TEPPQ6URK8 271 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 UQCC3Q6UW78 93 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 LYPD6BQ8NI32 183 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 P2RX4Q99571 388 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ITPR2Q14571 2701 aa6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PN81 502 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 CHRNA7P36544 502 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 GAMTQ14353 236 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 FAM120AOSQ5T036 256 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 OR4A5Q8NH83 315 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 C22orf15Q8WYQ4 148 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 CFHR4Q92496 578 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 MARVELD3Q96A59 401 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PXMP4Q9Y6I8 212 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 ACANP16112 2415 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 NBR2O15453 112 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 UBE2E1P51965 193 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 B2MP61769 119 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 VWC2Q2TAL6 325 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 RAB24Q969Q5 203 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PPV4 95 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-215ENST00000549143 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.72□□□□□ -1.33
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