RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 PDLIM4P50479 330 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 BPIFB3P59826 476 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 TBR1Q16650 682 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 COX19Q49B96 90 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 FAM78BQ5VT40 261 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 Q8NA96 180 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 NECAP1Q8NC96 275 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 OR4P4Q8NGL7 312 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 OR10D4PQ8NGN7 298 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 TMEM190Q8WZ59 177 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-205ENST00000546891 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 A0A1W2PRE2 83 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 XKRY2A2RUG3 117 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 IFITM10A6NMD0 228 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 K7ENP7 123 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 IGKV1-16P04430 117 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 SOD3P08294 240 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 C8orf88P0DMB2 117 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 OR10J1P30954 320 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 UCNP55089 124 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 SELENOTP62341 195 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 TEX38Q6PEX7 206 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 OR5R1Q8NH85 324 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 CCL17Q92583 94 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 C1orf159Q96HA4 380 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 GPR61Q9BZJ8 451 aa7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 A0A0U1RQK1 487 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 ZNF320A2RRD8 509 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 SHISA9B4DS77 424 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 CORTO00230 105 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 IGHV2-70P01814 119 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 OR10J4P0C629 311 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 DEFA4P12838 97 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 FABP4P15090 132 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 CCL3L1P16619 93 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 LOXP28300 417 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 COMPP49747 757 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 PRRX1P54821 245 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 DLX6P56179 175 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 GAMTQ14353 236 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 PSG5Q15238 335 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 C4orf17Q53FE4 359 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 PYY3Q5JQD4 70 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 UTF1Q5T230 341 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 TEX45Q8NA69 505 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 STXBP6Q8NFX7 210 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 TMEM18Q96B42 140 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 ELOVL1Q9BW60 279 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 DCAF16Q9NXF7 216 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 IL36BQ9NZH7 164 aa7.95□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 GTF3C1Q12789 2109 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 USF3Q68DE3 2245 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 E7EQL1 145 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 OR7C2O60412 319 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 GCGP01275 180 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 C1QTNF9P0C862 333 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 CHRNB4P30926 498 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 GNG4P50150 75 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 CNN1P51911 297 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 PAX2Q02962 417 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 TIGITQ495A1 244 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 MIR17HGQ75NE6 70 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 MMD2Q8IY49 270 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 THAP8Q8NA92 274 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 ZNF114Q8NC26 417 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 OR5T1Q8NG75 326 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 SGMS2Q8NHU3 365 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 TMEM133Q9H2Q1 129 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.94□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 TSTD3H0UI37 97 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 COX7A2P2O60397 106 aa7.93□□□□□ -1.14
CS-205ENST00000546891 ACTL6BO94805 426 aa7.93□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms