RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 H3BP45 60 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 OR8U8P0C7N1 319 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 AREGP15514 252 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 NPY1RP25929 384 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 PAX9P55771 341 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 RAB11AP62491 216 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 WT1-ASQ06250 92 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 ECSCRQ19T08 205 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 TMEM65Q6PI78 240 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 STX12Q86Y82 276 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 Q8N2B8 174 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 LFNGQ8NES3 379 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 OR1L6Q8NGR2 347 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 GON7Q9BXV9 100 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 FBXO7Q9Y3I1 522 aa9.44□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 TSPAN9O75954 239 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 TMEM50AO95807 157 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 APELAP0DMC3 54 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 DEFA4P12838 97 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 CTRB1P17538 263 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 BAXQ07812 192 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 BSXQ3C1V8 233 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 C2orf83Q53S99 150 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 CTRB2Q6GPI1 263 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 OR1P1Q8NH06 330 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 TNFSF18Q9UNG2 199 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 ZFHX3Q15911 3703 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 PLXNB1O43157 2135 aa9.43□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 LINC01548A6NM66 108 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 C15orf62A8K5M9 175 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 CORTO00230 105 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 ARPC5O15511 151 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 FBXO24O75426 580 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 IFNA4P05014 189 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 REG1AP05451 166 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 CRYGCP07315 174 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 RPL12P30050 165 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 ASPHD1Q5U4P2 390 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 Q6ZS46 218 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 STPG2Q8N412 459 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 TMEM252Q8N6L7 170 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 OR11H4Q8NGC9 324 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 AQP10Q96PS8 301 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 OR4C12Q96R67 309 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 P2RX4Q99571 388 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 MTORP42345 2549 aa9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 FN1P02751 2386 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 IGSF23A1L1A6 192 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 H3BUA1 57 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 METTL15P1P0C7V9 234 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 HKR1P10072 659 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 SULT1A1P50225 295 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 HBG1P69891 147 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 HBG2P69892 147 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 OR2F1Q13607 317 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 ZNF345Q14585 488 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 C19orf54Q5BKX5 351 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 ETV3LQ6ZN32 361 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 Q6ZSV7 163 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 OR10P1Q8NGE3 313 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 WNT10AQ9GZT5 417 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 MFFQ9GZY8 342 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 THYN1Q9P016 225 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 HSPB11Q9Y547 144 aa9.41□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 A0A0D9SG52 128 aa9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 RNF222A6NCQ9 220 aa9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 G3V318 75 aa9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 NDUFA7O95182 113 aa9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 SLC35B1P78383 322 aa9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 PVRIGQ6DKI7 326 aa9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 OR5T1Q8NG75 326 aa9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 C16orf95Q9H693 158 aa9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa9.4□□□□□ -0.9
LMO3-218ENST00000538020 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa9.39□□□□□ -0.91
LMO3-218ENST00000538020 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa9.39□□□□□ -0.91
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