RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483873.6

GTF3C4-202, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GTF3C4, Length 1,417 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4-202ENST00000483873 ATP5G2Q06055 141 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 C15orf32Q32M92 178 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 OR5B3Q8NH48 314 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 FKBP11Q9NYL4 201 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 FBXL7Q9UJT9 491 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 DMRT1Q9Y5R6 373 aa20.38■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 SFT2D2O95562 160 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 DEFA4P12838 97 aa20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 SEC14L6B5MCN3 397 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 OVOL1O14753 267 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 DHFRP00374 187 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 ANXA3P12429 323 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 SPNP16150 400 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 KLK9Q2XQG4 91 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM56Q96MV1 263 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 KLK9Q9UKQ9 250 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 S4R3C0 116 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A0B4J293 547 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 C9orf170A2RU37 121 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 ATG12O94817 140 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 MECP2P51608 486 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 KRTAP10-11P60412 298 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 TMEM268Q5VZI3 342 aa20.36■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV3-23P01764 117 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 DHRS2Q13268 280 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 ANKRD55Q3KP44 614 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 C4orf46Q504U0 113 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR61Q9BZJ8 451 aa20.35■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 PTTG1O95997 202 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 SPINK9Q5DT21 86 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 C9orf66Q5T8R8 295 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 PLET1Q6UQ28 207 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 LYG2Q86SG7 212 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 OR52B4Q8NGK2 314 aa20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
GTF3C4-202ENST00000483873 MFSD2BA6NFX1 497 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 MFAP2P55001 183 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PRCDQ00LT1 54 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 Q6ZRM9 215 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF429Q86V71 674 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC35G3Q8N808 338 aa20.33■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 BMPR1BO00238 502 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ST8SIA3O43173 380 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ZP3P21754 424 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 LGI3Q8N145 548 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 IL22RA2Q969J5 263 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CCDC140Q96MF4 163 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SEC22CQ9BRL7 303 aa20.32■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SRPXP78539 464 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 MARVELD1Q9BSK0 173 aa20.31■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PPP5D1E7EU14 171 aa20.3■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa20.3■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SLC25A24Q6NUK1 477 aa20.3■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 LYZL2Q7Z4W2 148 aa20.3■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 LRTM2Q8N967 370 aa20.3■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 GPR146Q96CH1 333 aa20.3■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa20.29■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 PLEKHA3Q9HB20 300 aa20.29■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 A0A0B4J2A0 478 aa20.28■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SYNJ2BPP57105 145 aa20.28■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 RGS21Q2M5E4 152 aa20.28■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 RPEL1Q2QD12 228 aa20.28■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 ACSM6Q6P461 480 aa20.28■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CLEC19AQ6UXS0 136 aa20.28■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 FAM219AQ8IW50 185 aa20.28■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 OR2C3Q8N628 320 aa20.28■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SHPKQ9UHJ6 478 aa20.28■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 SAP30O75446 220 aa20.27■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 IFNA17P01571 189 aa20.27■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 CACNG5Q9UF02 275 aa20.27■□□□□ 0.84
GTF3C4-202ENST00000483873 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa20.27■□□□□ 0.83
GTF3C4-202ENST00000483873 IL5P05113 134 aa20.27■□□□□ 0.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
GTF3C4-202ENST00000483873 MITD1Q8WV92 249 aa20.27■□□□□ 0.83
GTF3C4-202ENST00000483873 PDCD10Q9BUL8 212 aa20.27■□□□□ 0.83
GTF3C4-202ENST00000483873 THYN1Q9P016 225 aa20.27■□□□□ 0.83
GTF3C4-202ENST00000483873 CYB5BO43169 146 aa20.26■□□□□ 0.83
GTF3C4-202ENST00000483873 NMSQ5H8A3 153 aa20.26■□□□□ 0.83
GTF3C4-202ENST00000483873 COQ8AQ8NI60 647 aa20.26■□□□□ 0.83
GTF3C4-202ENST00000483873 ZNF502Q8TBZ5 544 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms